More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0081 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0081  amidohydrolase  100 
 
 
369 aa  767    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348917  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1044  amidohydrolase  48.78 
 
 
364 aa  353  4e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1276  amidohydrolase  44.2 
 
 
357 aa  309  4e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000371736  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1410  amidohydrolase  45.33 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1219  amidohydrolase  43.29 
 
 
369 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2682  amidohydrolase  37.14 
 
 
376 aa  223  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000743905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1824  amidohydrolase  36.8 
 
 
377 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0945  amidohydrolase  35.29 
 
 
376 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.74089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4083  peptidase, M20/M25/M40 family  36.12 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1157  peptidase, M20/M25/M40 family  36.12 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3890  M20/M25/M40 family peptidase  35.01 
 
 
376 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3738  M20/M25/M40 family peptidase  35.01 
 
 
376 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4193  M20/M25/M40 family peptidase  35.01 
 
 
376 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3995  peptidase, M20/M25/M40 family  35.01 
 
 
376 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3807  amidohydrolase  36 
 
 
376 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.393808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3722  M20/M25/M40 family peptidase  35.01 
 
 
376 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4029  M20/M25/M40 family peptidase  34.77 
 
 
376 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4100  peptidase, M20/M25/M40 family  34.77 
 
 
376 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0323014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1813  aminoacylase/N-acyl-L-amino acid amidohydrolase/hippurate hydrolase  33.95 
 
 
377 aa  205  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0294  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  33.96 
 
 
376 aa  202  6e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2834  amidohydrolase  32.16 
 
 
375 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.132688  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0773  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  32.89 
 
 
382 aa  176  7e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.197987  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0614  amidohydrolase  32.18 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  34.54 
 
 
390 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  35 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1761  amidohydrolase  32.95 
 
 
394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  35.08 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  33.51 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1675  amidohydrolase  29.19 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  31.66 
 
 
394 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  31.44 
 
 
393 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0669  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.23 
 
 
384 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  29.38 
 
 
387 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  30.42 
 
 
389 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  29.92 
 
 
387 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  30.62 
 
 
405 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  30.42 
 
 
386 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  31.02 
 
 
389 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  29.11 
 
 
387 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  29.27 
 
 
387 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  29.11 
 
 
387 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  29.27 
 
 
387 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  29.3 
 
 
387 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  30.87 
 
 
394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  29.81 
 
 
420 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  29.53 
 
 
465 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  30.05 
 
 
465 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  33.99 
 
 
390 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  30.46 
 
 
399 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  29.53 
 
 
466 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  31.18 
 
 
395 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  29.11 
 
 
387 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  30.16 
 
 
403 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  29 
 
 
387 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  30.19 
 
 
387 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  30.11 
 
 
397 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  30.16 
 
 
403 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  30.26 
 
 
393 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  29.73 
 
 
388 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  30.03 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  29.81 
 
 
387 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  29.76 
 
 
398 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  29.82 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  29.37 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  27.95 
 
 
384 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  30.25 
 
 
387 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  27.7 
 
 
400 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  29.86 
 
 
381 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  31.82 
 
 
397 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0968  amidohydrolase family protein  29.84 
 
 
383 aa  145  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  28.16 
 
 
402 aa  145  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  28.38 
 
 
387 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  30.85 
 
 
390 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  29.02 
 
 
400 aa  145  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  28.65 
 
 
386 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  30.73 
 
 
399 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04470  amidohydrolase  29.26 
 
 
399 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.171229  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  29.57 
 
 
435 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  29.63 
 
 
394 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  28.87 
 
 
398 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  28.46 
 
 
467 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  30.45 
 
 
392 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  31.28 
 
 
437 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  28.64 
 
 
439 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  30.31 
 
 
399 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  28.27 
 
 
400 aa  143  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  30.24 
 
 
394 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28190  amidohydrolase  32.84 
 
 
378 aa  142  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000108977  normal  0.832169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  29.81 
 
 
440 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  29.97 
 
 
408 aa  142  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  27.49 
 
 
480 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  29.16 
 
 
471 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  29.67 
 
 
470 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  29.16 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  26.98 
 
 
385 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  30.29 
 
 
396 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  31.96 
 
 
398 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  31.4 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  28.53 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0512  peptidase M20D, amidohydrolase  28.69 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>