More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0614 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0614  amidohydrolase  100 
 
 
381 aa  791    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0773  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  55.12 
 
 
382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.197987  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0669  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  52.38 
 
 
384 aa  443  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1813  aminoacylase/N-acyl-L-amino acid amidohydrolase/hippurate hydrolase  52.91 
 
 
377 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0294  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  51.34 
 
 
376 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0945  amidohydrolase  49.73 
 
 
376 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.74089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1824  amidohydrolase  47.85 
 
 
377 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2682  amidohydrolase  44.83 
 
 
376 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000743905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3807  amidohydrolase  43.77 
 
 
376 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.393808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4083  peptidase, M20/M25/M40 family  43.5 
 
 
376 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1157  peptidase, M20/M25/M40 family  43.5 
 
 
376 aa  346  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3890  M20/M25/M40 family peptidase  42.9 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3738  M20/M25/M40 family peptidase  42.9 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3995  peptidase, M20/M25/M40 family  42.9 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4193  M20/M25/M40 family peptidase  42.9 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4029  M20/M25/M40 family peptidase  42.63 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293522  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3722  M20/M25/M40 family peptidase  42.9 
 
 
376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4100  peptidase, M20/M25/M40 family  42.63 
 
 
376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0323014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2834  amidohydrolase  41.87 
 
 
375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.132688  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  37.24 
 
 
393 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  34.96 
 
 
393 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  34.73 
 
 
379 aa  225  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  33.25 
 
 
387 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  34.25 
 
 
386 aa  222  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  33.95 
 
 
388 aa  222  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  34.65 
 
 
407 aa  219  7e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  33.95 
 
 
388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  34.66 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  34.84 
 
 
382 aa  216  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  34.34 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  34.59 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  34.71 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  33.52 
 
 
388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  34.84 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  34.93 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  33.06 
 
 
381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  34.92 
 
 
389 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  33.77 
 
 
390 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  31.3 
 
 
391 aa  211  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  33.77 
 
 
394 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3295  peptidase M20D, amidohydrolase  33.16 
 
 
391 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.353614  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  33.15 
 
 
381 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  36.07 
 
 
389 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  35.04 
 
 
405 aa  209  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  34.11 
 
 
390 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  34.76 
 
 
390 aa  209  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  35.25 
 
 
392 aa  209  8e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  31.77 
 
 
381 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.6 
 
 
381 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  35.12 
 
 
398 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  32.2 
 
 
387 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  35.12 
 
 
398 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  32.04 
 
 
381 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  33.16 
 
 
404 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  31.94 
 
 
387 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  35.04 
 
 
403 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  33.07 
 
 
410 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  32.17 
 
 
389 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  36.78 
 
 
399 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  33.33 
 
 
385 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  35.88 
 
 
405 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  34.06 
 
 
403 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  31.96 
 
 
381 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  33.59 
 
 
409 aa  206  7e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.38 
 
 
401 aa  206  8e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  34.31 
 
 
408 aa  205  9e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  34.05 
 
 
399 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  33.51 
 
 
380 aa  204  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  35.83 
 
 
393 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  34.76 
 
 
403 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  34.05 
 
 
400 aa  205  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  32.72 
 
 
388 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  34.11 
 
 
385 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  31.82 
 
 
389 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  34.24 
 
 
398 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  34.84 
 
 
396 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  33.85 
 
 
405 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  34.48 
 
 
395 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  33.96 
 
 
384 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  34.2 
 
 
404 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1689  amidohydrolase  31.75 
 
 
385 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  34.05 
 
 
388 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  33.95 
 
 
385 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  33.51 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  32.88 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  31.89 
 
 
390 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  33.07 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  34.51 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2179  amidohydrolase  33.06 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833898  normal  0.575344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  33.51 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  32.99 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  32.99 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  34.34 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1219  amidohydrolase  31.99 
 
 
369 aa  200  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  32.28 
 
 
391 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  32.35 
 
 
379 aa  200  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  34.49 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  32.09 
 
 
390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  33.94 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  33.62 
 
 
395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>