More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04470  amidohydrolase  100 
 
 		 399 aa  786    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.171229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7849  Aminoacylase  44.17 
 
 		 419 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  34.1 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2454  amidohydrolase  32.02 
 
 		 394 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  39.29 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  38.94 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  35.21 
 
 		 404 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  32.9 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  33.05 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  35.41 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.71 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  35.41 
 
 		 392 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  32.78 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  32.41 
 
 		 381 aa  176  8e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  32.88 
 
 		 381 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  38.12 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2948  amidohydrolase  33.5 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  34.68 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  32.98 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  41.75 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  32.17 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  37.99 
 
 		 394 aa  173  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  31.64 
 
 		 393 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  31.18 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  31.81 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  33.52 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  31.86 
 
 		 390 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1675  amidohydrolase  33.7 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  36.02 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  35.86 
 
 		 396 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  37.25 
 
 		 393 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  36.72 
 
 		 415 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  31.67 
 
 		 407 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  31.52 
 
 		 386 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  33.81 
 
 		 438 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  29.67 
 
 		 407 aa  169  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  31.16 
 
 		 395 aa  169  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  32.54 
 
 		 381 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.27 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  33.71 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  34.64 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  32.81 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  33.16 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  33.24 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  34.37 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  32.04 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  32.04 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  32.56 
 
 		 398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  32.3 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1019  amidohydrolase  33.87 
 
 		 428 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.533983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  35.57 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  29.3 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  36.77 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  34.86 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  31.65 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  37.68 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  36.58 
 
 		 395 aa  166  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  33.52 
 
 		 449 aa  166  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  33.62 
 
 		 397 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  34.33 
 
 		 399 aa  166  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1219  amidohydrolase  30.89 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0823  amidohydrolase  33.16 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  31.74 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  30.46 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  32.74 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  32.87 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  33.68 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04870  amidohydrolase  32.73 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.946218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  34.18 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  31.32 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  30.52 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  32.24 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  30.97 
 
 		 390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  35.21 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  30.81 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2682  amidohydrolase  30.39 
 
 		 376 aa  163  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000743905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  32.76 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  31 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  29.53 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  29.53 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  34.73 
 
 		 406 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  34 
 
 		 390 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  32.09 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  32.86 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  32.45 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  33.82 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  34.5 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  32.74 
 
 		 400 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0113  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  32.69 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  35.09 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  34.55 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  31.44 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  35.47 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  35.8 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  35.09 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  35.88 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1133  amidohydrolase  34.06 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  35.09 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  32.39 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  35.8 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>