More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1281 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  100 
 
 
413 aa  839    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  56.72 
 
 
409 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
414 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
423 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  38.96 
 
 
446 aa  299  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  39.03 
 
 
432 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  39.59 
 
 
441 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  35.97 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 
440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  38.5 
 
 
424 aa  282  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 
419 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
401 aa  252  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  34.85 
 
 
474 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  32.49 
 
 
435 aa  246  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  37.5 
 
 
412 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  36.34 
 
 
418 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 
417 aa  229  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  32.84 
 
 
428 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 
421 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.41 
 
 
418 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
408 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 
412 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 
410 aa  220  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  34.03 
 
 
413 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  32.47 
 
 
423 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  35.17 
 
 
430 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  31.44 
 
 
414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  31.57 
 
 
421 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  30.41 
 
 
419 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  31.42 
 
 
403 aa  206  8e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 
435 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  31.78 
 
 
474 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  31.19 
 
 
407 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  34.29 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  29.05 
 
 
431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 
440 aa  199  6e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  30.55 
 
 
410 aa  197  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  30.24 
 
 
436 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
414 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
442 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 
414 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
418 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
453 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.57 
 
 
431 aa  186  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  30.6 
 
 
426 aa  186  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  29.95 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  30.67 
 
 
414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  28.35 
 
 
410 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
461 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  30 
 
 
414 aa  176  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
405 aa  176  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.11 
 
 
426 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 
418 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.92 
 
 
413 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  32.43 
 
 
450 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  28.65 
 
 
424 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  27 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  27 
 
 
425 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  30.23 
 
 
429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  30.56 
 
 
457 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  28.92 
 
 
412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  29.25 
 
 
412 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  29.59 
 
 
441 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
378 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
419 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  28.54 
 
 
413 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  28.54 
 
 
413 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
417 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  27.8 
 
 
413 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  31.01 
 
 
450 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  28.64 
 
 
416 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  29.32 
 
 
414 aa  159  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
424 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.23 
 
 
446 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  28.61 
 
 
416 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 
450 aa  156  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
441 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  27.1 
 
 
405 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
442 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
420 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  27.14 
 
 
452 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  28.21 
 
 
418 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
415 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
428 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
402 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  28.13 
 
 
412 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
404 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  28.43 
 
 
426 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  27.2 
 
 
441 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  28.03 
 
 
405 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  27.7 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6034  major facilitator transporter  26.05 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  normal  0.0406983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>