More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0669 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  100 
 
 
289 aa  605  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  91.61 
 
 
286 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  91.61 
 
 
286 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  91.61 
 
 
286 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  91.61 
 
 
286 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  91.26 
 
 
286 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  90.21 
 
 
288 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  90.21 
 
 
288 aa  552  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  90.21 
 
 
288 aa  552  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  90.21 
 
 
288 aa  552  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  90.21 
 
 
288 aa  552  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  90.56 
 
 
288 aa  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  90.21 
 
 
288 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  90.21 
 
 
288 aa  552  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  89.51 
 
 
288 aa  548  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  78.52 
 
 
287 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  78.28 
 
 
296 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  78.28 
 
 
296 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  77.93 
 
 
296 aa  484  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  78.52 
 
 
287 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  76.06 
 
 
287 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  77.03 
 
 
287 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1964  spermidine synthase  60.07 
 
 
291 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.569543  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  58.01 
 
 
286 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  57.65 
 
 
286 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  57.39 
 
 
291 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  56.83 
 
 
286 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  57.55 
 
 
286 aa  346  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  56.83 
 
 
286 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0273  spermidine synthase  56.78 
 
 
276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000512429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  52.69 
 
 
283 aa  305  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  52.69 
 
 
290 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1389  spermidine synthase  52.9 
 
 
284 aa  279  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625706  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  46.15 
 
 
287 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  45.68 
 
 
289 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  43.01 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  40.57 
 
 
277 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  40.29 
 
 
275 aa  215  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  39.36 
 
 
283 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2169  spermidine synthase  43.37 
 
 
296 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  39.36 
 
 
283 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  38.6 
 
 
286 aa  206  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  39.71 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  39.62 
 
 
299 aa  200  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  39.11 
 
 
302 aa  199  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  37.1 
 
 
284 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  38.17 
 
 
275 aa  199  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  36.53 
 
 
288 aa  198  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  36.6 
 
 
275 aa  196  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  37.54 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  38.22 
 
 
273 aa  195  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  40.61 
 
 
283 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  35.77 
 
 
276 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  38.25 
 
 
283 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  38.89 
 
 
275 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  37.41 
 
 
296 aa  192  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  37.41 
 
 
293 aa  192  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  35.47 
 
 
292 aa  192  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  38.87 
 
 
277 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  38.04 
 
 
275 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  38.52 
 
 
275 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  38.52 
 
 
275 aa  191  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  38.52 
 
 
275 aa  191  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  38.52 
 
 
275 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  38.52 
 
 
275 aa  191  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  38.52 
 
 
275 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  38.52 
 
 
275 aa  191  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  38.52 
 
 
275 aa  191  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  37.74 
 
 
290 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  38.15 
 
 
275 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  36.64 
 
 
283 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  36.23 
 
 
280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  36.6 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  36.14 
 
 
291 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  36.74 
 
 
279 aa  187  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40259  predicted protein  35.77 
 
 
316 aa  187  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0644688  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  35.47 
 
 
280 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  36.65 
 
 
292 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  38.85 
 
 
271 aa  186  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  38.46 
 
 
278 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  37.41 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  38.66 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  37.73 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  36.88 
 
 
279 aa  182  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26437  Spermidine synthase  39.86 
 
 
319 aa  181  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.047075 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  36.17 
 
 
328 aa  181  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  37.31 
 
 
314 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  38.93 
 
 
304 aa  178  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  35.32 
 
 
300 aa  178  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  35.66 
 
 
310 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  36.11 
 
 
283 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  40 
 
 
275 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  36.73 
 
 
748 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  34.21 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  35.93 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2794  spermidine synthase  34.89 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401374  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  36 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  35.31 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  33.58 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  35.09 
 
 
278 aa  168  9e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>