More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0048 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  100 
 
 
400 aa  776    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  73.54 
 
 
398 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  69.23 
 
 
397 aa  518  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  70.79 
 
 
407 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  66.13 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  66.06 
 
 
410 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  68.35 
 
 
376 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  64.71 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  66.32 
 
 
410 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  62.44 
 
 
401 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  66.22 
 
 
404 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  66.4 
 
 
411 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  64.36 
 
 
408 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  67.04 
 
 
403 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  67.04 
 
 
403 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  59.06 
 
 
409 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  64.91 
 
 
402 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  56.2 
 
 
402 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  55.15 
 
 
404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  57.29 
 
 
416 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  60.1 
 
 
408 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  57.41 
 
 
420 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  53.09 
 
 
402 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 
403 aa  379  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  56.12 
 
 
402 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  47.14 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  47.19 
 
 
400 aa  296  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  47.7 
 
 
433 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  42.39 
 
 
401 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  47.21 
 
 
384 aa  292  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 
395 aa  286  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  49.12 
 
 
398 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  49.12 
 
 
398 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  45.13 
 
 
394 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  45.01 
 
 
403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  45.9 
 
 
395 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  41.11 
 
 
408 aa  271  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  39.33 
 
 
396 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  44.38 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  44.64 
 
 
379 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  44.38 
 
 
403 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  41.42 
 
 
413 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  44.44 
 
 
403 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  44.66 
 
 
400 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  44.66 
 
 
400 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  46.43 
 
 
376 aa  259  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  42.28 
 
 
400 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  39.73 
 
 
451 aa  255  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  39.73 
 
 
451 aa  255  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  39.73 
 
 
451 aa  255  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  39.73 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  39.73 
 
 
394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  39.73 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  44.16 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  37.81 
 
 
401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 
397 aa  209  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  33.78 
 
 
408 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
412 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  34.17 
 
 
408 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  37.68 
 
 
402 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  34.17 
 
 
408 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
402 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  34.01 
 
 
413 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  32.45 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  34.26 
 
 
399 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  33.9 
 
 
415 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 
415 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  34.67 
 
 
406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
390 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  33.07 
 
 
394 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
402 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
422 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  32.51 
 
 
410 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
402 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
397 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
398 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  31.18 
 
 
407 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  30.2 
 
 
404 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 
735 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  29.2 
 
 
392 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  28.9 
 
 
404 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 
387 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  32.49 
 
 
397 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  29.87 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  32.54 
 
 
399 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
403 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  30.2 
 
 
393 aa  133  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  28.38 
 
 
409 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 
390 aa  129  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  28.42 
 
 
419 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  27.62 
 
 
388 aa  127  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
390 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  29.41 
 
 
426 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
403 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  28.98 
 
 
404 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  28.98 
 
 
404 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  28.98 
 
 
404 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  28.98 
 
 
404 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  36.15 
 
 
407 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>