63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2974 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  50.48 
 
 		 215 aa  217  8.999999999999998e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  49.53 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.29 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  53.4 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  56.52 
 
 		 199 aa  204  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  55.56 
 
 		 218 aa  197  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  47.39 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  49.75 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  52.94 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  47.52 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  46.51 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  47.06 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  50 
 
 		 255 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  50.54 
 
 		 216 aa  177  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  47.64 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.24 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  42.6 
 
 		 223 aa  167  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  42.41 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  42.72 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  38.86 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  43.62 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  45.9 
 
 		 204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  42.45 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  38.79 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  42 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.16 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  47.15 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  45.69 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  43.62 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.25 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.3 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.27 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  40 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  32.07 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.95 
 
 		 544 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  32.07 
 
 		 196 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  33.51 
 
 		 553 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  33.51 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  34.81 
 
 		 545 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.9 
 
 		 559 aa  99  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  32.97 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  32.97 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.73 
 
 		 550 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.02 
 
 		 570 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.83 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  34.21 
 
 		 196 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  33.86 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.11 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  29.19 
 
 		 594 aa  79  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  28.84 
 
 		 598 aa  79  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.56 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.38 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.8 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  30.05 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.54 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  29.28 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  27.75 
 
 		 558 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  27.55 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  26.47 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.47 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.75 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0737  hypothetical protein  31.94 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.821766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>