More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3201 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  84.15 
 
 		 247 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  74.49 
 
 		 248 aa  374  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  74.38 
 
 		 245 aa  363  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  70.73 
 
 		 246 aa  360  9e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  61.94 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  56.8 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  56.33 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  56.45 
 
 		 250 aa  288  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  58.3 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  55.47 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  54.8 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  59 
 
 		 247 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  56.05 
 
 		 250 aa  284  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  56.05 
 
 		 250 aa  284  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  58.3 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  55.69 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  56.68 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  55.14 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  56.49 
 
 		 247 aa  276  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  55.65 
 
 		 248 aa  274  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  55.24 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  52.63 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  55.19 
 
 		 247 aa  272  5.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  53.44 
 
 		 247 aa  271  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  52.23 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  50.2 
 
 		 251 aa  270  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  55.65 
 
 		 248 aa  269  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  55.6 
 
 		 249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  51.81 
 
 		 250 aa  268  7e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  54.62 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  54.03 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  51.87 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  53.63 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  51.41 
 
 		 250 aa  264  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  54.44 
 
 		 248 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  51.63 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  52.26 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  55.65 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  55.65 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  55.65 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  55.65 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  55.65 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  55.65 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  55.24 
 
 		 246 aa  262  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  55.24 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  55.24 
 
 		 246 aa  262  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  54.44 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  53.41 
 
 		 248 aa  262  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  55.24 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  55.24 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  55.24 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  54.84 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  53.23 
 
 		 248 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  54.84 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  53.41 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  52.26 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  53.01 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  51.61 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  52.08 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  53.44 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  50.81 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  51.41 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  56.85 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  54.84 
 
 		 246 aa  258  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  53.41 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  52.61 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  52.5 
 
 		 246 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  56.56 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  50.82 
 
 		 249 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  53.47 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  51.78 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  52.02 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  52.63 
 
 		 248 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  53.82 
 
 		 249 aa  255  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  49.19 
 
 		 250 aa  254  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  53.01 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  53.01 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  51.61 
 
 		 249 aa  254  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  53.01 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  49.6 
 
 		 250 aa  254  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  54.44 
 
 		 249 aa  254  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  55.6 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  54.03 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  54.84 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  54.44 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  49.41 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  52.61 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  54 
 
 		 248 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  52.42 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  52.42 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  52.02 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  52.42 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  56.28 
 
 		 246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  54.03 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  52.42 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  53.63 
 
 		 247 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  52.19 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  52.42 
 
 		 248 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>