More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0987 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  100 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  64.65 
 
 		 221 aa  291  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  66.35 
 
 		 220 aa  289  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  60.99 
 
 		 219 aa  284  9e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 210 aa  281  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  63.01 
 
 		 221 aa  280  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 211 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  61.16 
 
 		 222 aa  279  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 211 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  61.68 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 211 aa  278  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 210 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  61.32 
 
 		 214 aa  276  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 218 aa  275  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 211 aa  274  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  60.38 
 
 		 210 aa  275  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 218 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  60.47 
 
 		 226 aa  271  9e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 219 aa  270  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  57.4 
 
 		 218 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  56.7 
 
 		 226 aa  265  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  59.81 
 
 		 278 aa  265  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  57.55 
 
 		 229 aa  261  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  56.31 
 
 		 229 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  52.49 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  60.1 
 
 		 224 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  51.82 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  57.62 
 
 		 223 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  58.85 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  57.71 
 
 		 227 aa  259  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  56.28 
 
 		 223 aa  258  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  58.41 
 
 		 272 aa  258  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  56.09 
 
 		 222 aa  258  8e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  56.09 
 
 		 222 aa  258  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 223 aa  258  8e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 224 aa  258  9e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  56.88 
 
 		 219 aa  257  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  59.13 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  54.42 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  57.89 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  55.16 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 341 aa  255  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4907  30S ribosomal protein S3  54.09 
 
 		 308 aa  254  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0285  ribosomal protein S3  56.68 
 
 		 227 aa  254  9e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105887  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0397  30S ribosomal protein S3  53.64 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  56.68 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 243 aa  252  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 244 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  51.54 
 
 		 230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0271  ribosomal protein S3  50.42 
 
 		 231 aa  252  5.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386927  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  53.95 
 
 		 223 aa  251  6e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 229 aa  251  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  53.81 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0344  30S ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.212701  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3993  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 285 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000371657 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  56.31 
 
 		 238 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3989  ribosomal protein S3  57.01 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 223 aa  250  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3437  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 299 aa  250  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0722902  normal  0.23465 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 213 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  55.5 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  58.05 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 219 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 219 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 219 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 219 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 219 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 219 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 219 aa  250  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 219 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0085  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 213 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0561951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  53.36 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1388  ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000147374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 219 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 278 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1298  ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000309982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  55.14 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  55.71 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1759  30S ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.341094  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0411  30S ribosomal protein S3  52.7 
 
 		 234 aa  249  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000407392  normal  0.239149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  51.1 
 
 		 236 aa  248  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 217 aa  248  4e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  52.42 
 
 		 230 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  52.42 
 
 		 230 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 217 aa  248  5e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  52.42 
 
 		 230 aa  248  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0852  30S ribosomal protein S3  52.8 
 
 		 228 aa  248  5e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>