More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3989 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3989  ribosomal protein S3  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1279  ribosomal protein S3  82.03 
 
 		 219 aa  368  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  57.73 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  57.01 
 
 		 220 aa  263  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  56.54 
 
 		 221 aa  254  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  57.01 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  57.53 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  53.42 
 
 		 218 aa  248  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  57.48 
 
 		 220 aa  247  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  55.25 
 
 		 218 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  54.09 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  54.93 
 
 		 217 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  53.52 
 
 		 211 aa  237  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  53.52 
 
 		 211 aa  237  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  53.52 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  50.7 
 
 		 226 aa  236  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 252 aa  236  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  53.42 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  54.09 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  54.25 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  52.58 
 
 		 211 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  53.99 
 
 		 217 aa  236  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 210 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  53.52 
 
 		 222 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1027  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 232 aa  234  8e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000269281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  52.36 
 
 		 210 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1869  30S ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.437759  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1698  30S ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141955  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  50.45 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  51.43 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 241 aa  232  3e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  52.58 
 
 		 262 aa  232  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 223 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 223 aa  231  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 223 aa  231  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  52.8 
 
 		 223 aa  231  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2075  30S ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000597186  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0090  30S ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  52.63 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  52.73 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  52.27 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  52.27 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  52.27 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  52.27 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  52.27 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  52.15 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  52.27 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  52.27 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  52.27 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  52.27 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  50 
 
 		 227 aa  228  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 231 aa  228  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  50 
 
 		 227 aa  228  4e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  50.72 
 
 		 229 aa  228  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  51.67 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 231 aa  228  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  50.91 
 
 		 219 aa  228  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  51.2 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  53.67 
 
 		 217 aa  228  7e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 217 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 217 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  53.11 
 
 		 241 aa  227  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  50.72 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  51.13 
 
 		 222 aa  227  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  52.11 
 
 		 260 aa  227  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  51.42 
 
 		 241 aa  227  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  49.76 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  51.17 
 
 		 237 aa  226  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>