More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1279 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1279  ribosomal protein S3  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3989  ribosomal protein S3  82.03 
 
 		 218 aa  368  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  57.66 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  58.18 
 
 		 218 aa  254  9e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  57.28 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  55.91 
 
 		 218 aa  248  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  52.94 
 
 		 219 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 218 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  54.79 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 223 aa  241  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  55.24 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  54.21 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  54.21 
 
 		 217 aa  238  8e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  53.55 
 
 		 214 aa  237  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  54.21 
 
 		 217 aa  236  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  52.49 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  54.21 
 
 		 217 aa  234  8e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  53.74 
 
 		 262 aa  232  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 210 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  51.34 
 
 		 222 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  49.77 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  52.68 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 223 aa  229  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  50.71 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  51.63 
 
 		 222 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  51.63 
 
 		 222 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 248 aa  228  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  51.13 
 
 		 219 aa  227  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  51.66 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  52.07 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  52.07 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  52.34 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  48.6 
 
 		 211 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 243 aa  225  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  52.05 
 
 		 217 aa  225  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  51.43 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  52.73 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 221 aa  224  6e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  52.11 
 
 		 241 aa  224  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  51.43 
 
 		 210 aa  224  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  50.48 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  51.43 
 
 		 232 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  48.6 
 
 		 211 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  51.43 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  50.24 
 
 		 224 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  50.48 
 
 		 239 aa  223  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  48.6 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  49.3 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  50.48 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  51.63 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  51.43 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  50.48 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  49.53 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  48.4 
 
 		 222 aa  222  4e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  47.2 
 
 		 211 aa  221  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  50.95 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1388  ribosomal protein S3  55.02 
 
 		 209 aa  221  9e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000147374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  49.52 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  48.85 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1298  ribosomal protein S3  55.02 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000309982  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  49.05 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  49.05 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>