More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0087 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
186 aa  380  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  98.92 
 
 
186 aa  377  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  68.21 
 
 
173 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  71.17 
 
 
172 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  69.33 
 
 
169 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  68.79 
 
 
173 aa  240  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  66.67 
 
 
168 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  65.66 
 
 
186 aa  230  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  67.5 
 
 
172 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  65.45 
 
 
170 aa  227  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  58.02 
 
 
167 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  57.83 
 
 
169 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  57.83 
 
 
169 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  57.83 
 
 
169 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  57.23 
 
 
169 aa  191  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  56.63 
 
 
169 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  56.63 
 
 
169 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  56.02 
 
 
169 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  57.14 
 
 
171 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  57.14 
 
 
171 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  57.14 
 
 
171 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  57.14 
 
 
171 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  57.14 
 
 
171 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  57.14 
 
 
171 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  57.14 
 
 
171 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  54.22 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.66 
 
 
169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  55.9 
 
 
171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  54.17 
 
 
174 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  54.44 
 
 
191 aa  174  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.44 
 
 
192 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.98 
 
 
192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  53.57 
 
 
186 aa  171  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  52.1 
 
 
204 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  47.9 
 
 
175 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  43.93 
 
 
322 aa  148  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  47.4 
 
 
166 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  48.03 
 
 
174 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 
309 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.65 
 
 
166 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  48.32 
 
 
172 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  46.67 
 
 
175 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  46.84 
 
 
313 aa  141  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  45.18 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  47.62 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  45.68 
 
 
175 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  45.75 
 
 
304 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  44.64 
 
 
180 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  47.24 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  45.62 
 
 
175 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  45.62 
 
 
175 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  45.62 
 
 
175 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  48.63 
 
 
171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  43.95 
 
 
172 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  43.95 
 
 
172 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  46.67 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  46.75 
 
 
168 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  43.79 
 
 
408 aa  127  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  44.31 
 
 
311 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
170 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.51 
 
 
184 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  41.94 
 
 
183 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.14 
 
 
160 aa  124  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  45.45 
 
 
156 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  42.11 
 
 
182 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.29 
 
 
311 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  51.03 
 
 
166 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  44.76 
 
 
156 aa  122  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.57 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 
311 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  45.51 
 
 
172 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  44.3 
 
 
191 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  44.3 
 
 
191 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  44.3 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  38.32 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.99 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.74 
 
 
191 aa  117  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1986  flavin reductase domain-containing protein  40.82 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46.22 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  42.48 
 
 
174 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  37.65 
 
 
306 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  50 
 
 
166 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 
166 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.76 
 
 
311 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  48.3 
 
 
172 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  39.73 
 
 
161 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
393 aa  114  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  38.16 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  44.3 
 
 
168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  37.67 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  37.67 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  43.71 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  40.65 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  40.65 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  43.14 
 
 
173 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  42.11 
 
 
196 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
161 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
226 aa  111  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  40.62 
 
 
161 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  41.92 
 
 
181 aa  111  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>