172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3620 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
162 aa  336  8e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  41.98 
 
 
162 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  36.08 
 
 
157 aa  101  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.81 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.9 
 
 
157 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.95 
 
 
178 aa  98.2  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  34.81 
 
 
156 aa  94.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  32.93 
 
 
164 aa  94  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  36.13 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.91 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  34.78 
 
 
166 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.25 
 
 
169 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.12 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  30.86 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.25 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  36.3 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  35.04 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.61 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  32.89 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  33.14 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  35.62 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  36.65 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  28.12 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  28.12 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  31.95 
 
 
187 aa  72  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  28.12 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  28.12 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  28.12 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  35.34 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  28.12 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.68 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  28.39 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  34.3 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.75 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.85 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  28.21 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  28.12 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  28.39 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  32.41 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.31 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  33.13 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.13 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  30.39 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  32.72 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  32.73 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  30.67 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  33.57 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  33.33 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  31.01 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  34.97 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.34 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  30.67 
 
 
186 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  35.78 
 
 
185 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  30.67 
 
 
160 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.01 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  28.77 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.95 
 
 
181 aa  58.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.86 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  28.32 
 
 
185 aa  57.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  31.55 
 
 
174 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  35.58 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.58 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  35.58 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  30.32 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  35.14 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  28.74 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  35.58 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  35.58 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  35.09 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  31.82 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  35.58 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  35.58 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  35.58 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  35.58 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  29.71 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.62 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.3 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  30.18 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  30.23 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  30.23 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  41.67 
 
 
183 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  41.67 
 
 
183 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  41.67 
 
 
183 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.92 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.21 
 
 
162 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  30 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  34.93 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  30.13 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  27.45 
 
 
222 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  31.06 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  33.56 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  30.57 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.5 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  28.82 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  28 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  28.09 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>