More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2274 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 402 aa  830    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  66.41 
 
 		 414 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  62.5 
 
 		 392 aa  506  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  64.42 
 
 		 394 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  61.34 
 
 		 392 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  60.16 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  60.68 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  61.24 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  60.36 
 
 		 400 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  58.16 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  59.48 
 
 		 398 aa  473  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  59.59 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  60.05 
 
 		 404 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  55.87 
 
 		 388 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  58.59 
 
 		 382 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  58.44 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  61.07 
 
 		 392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  58.22 
 
 		 390 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  58.87 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  56.7 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  56.7 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  56.48 
 
 		 398 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  56.17 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  59.06 
 
 		 382 aa  435  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  57.51 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  56.66 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  54.66 
 
 		 398 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  53.06 
 
 		 409 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  54.59 
 
 		 403 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  52.73 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  53.32 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  52.6 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  51.3 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  51.6 
 
 		 379 aa  391  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  51.17 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  52.6 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.39 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  51.6 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  51.3 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  50.65 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  49.22 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  48.45 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  49.22 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  48.51 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  48.58 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.35 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  50 
 
 		 407 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  50.52 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  48.33 
 
 		 403 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  48.06 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  48.4 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  47.66 
 
 		 402 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  48.31 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  46.48 
 
 		 388 aa  364  2e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  49.22 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 383 aa  362  4e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  49.23 
 
 		 405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  49.74 
 
 		 403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  46.89 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  46.77 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  49.61 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  46.09 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  47.29 
 
 		 389 aa  359  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  47.23 
 
 		 380 aa  358  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  45.84 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  47.03 
 
 		 389 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  46.48 
 
 		 393 aa  357  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  49.09 
 
 		 386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  46.23 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  47.88 
 
 		 380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  46.77 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  47.41 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  46.51 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  47.01 
 
 		 403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  46.49 
 
 		 397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  45.97 
 
 		 407 aa  356  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  46.77 
 
 		 404 aa  356  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  45.97 
 
 		 407 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  45.97 
 
 		 407 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  45.97 
 
 		 407 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  45.71 
 
 		 407 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  45.97 
 
 		 407 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  45.97 
 
 		 407 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  45.97 
 
 		 407 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  45.97 
 
 		 407 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  45.97 
 
 		 407 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  46.51 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  46.51 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>