298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1273 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  49.37 
 
 		 638 aa  638    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  100 
 
 		 627 aa  1281    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  49.52 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  47.91 
 
 		 622 aa  612  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  46.52 
 
 		 630 aa  591  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  41.12 
 
 		 652 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  40.5 
 
 		 650 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  39.91 
 
 		 657 aa  485  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  39.49 
 
 		 647 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  38.24 
 
 		 644 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  38.85 
 
 		 640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  38.85 
 
 		 640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  38.98 
 
 		 640 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  38.18 
 
 		 640 aa  445  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  38.08 
 
 		 635 aa  444  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  41.6 
 
 		 529 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  37.8 
 
 		 608 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  37 
 
 		 642 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  34.71 
 
 		 647 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  35.21 
 
 		 612 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  38.85 
 
 		 535 aa  364  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  32.25 
 
 		 618 aa  362  9e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  34.1 
 
 		 616 aa  356  7.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  35.75 
 
 		 627 aa  355  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  33.17 
 
 		 615 aa  353  5e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  34.14 
 
 		 821 aa  352  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  35.92 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  38.67 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  35.56 
 
 		 521 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  34.43 
 
 		 592 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  33 
 
 		 592 aa  334  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  33.17 
 
 		 592 aa  330  3e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  31.76 
 
 		 614 aa  330  6e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  30.95 
 
 		 690 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  31.36 
 
 		 612 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  30.43 
 
 		 683 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  34.25 
 
 		 611 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  31.08 
 
 		 673 aa  318  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  30.69 
 
 		 694 aa  316  9e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  31.08 
 
 		 673 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  33.22 
 
 		 605 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  31.54 
 
 		 673 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  32.19 
 
 		 615 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  32.49 
 
 		 570 aa  303  6.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  32.79 
 
 		 581 aa  303  9e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  29.97 
 
 		 679 aa  302  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  33.11 
 
 		 598 aa  294  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  31.27 
 
 		 610 aa  286  9e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  29.82 
 
 		 606 aa  282  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  31.83 
 
 		 558 aa  280  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  30.42 
 
 		 612 aa  247  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  34.45 
 
 		 549 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  28.96 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  31.02 
 
 		 426 aa  207  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  29.77 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  31.89 
 
 		 538 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  28.44 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  27.86 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  27.87 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  26.85 
 
 		 416 aa  164  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  28.27 
 
 		 410 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  25.34 
 
 		 555 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  26.68 
 
 		 534 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  26.38 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.14 
 
 		 685 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.63 
 
 		 554 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  23.57 
 
 		 514 aa  94.7  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.47 
 
 		 540 aa  84  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.4 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  22.62 
 
 		 540 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  22.67 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  24.38 
 
 		 530 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  25.94 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.83 
 
 		 407 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.47 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.19 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.28 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.97 
 
 		 342 aa  60.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.33 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  38.03 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.28 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  35.21 
 
 		 407 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.68 
 
 		 386 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  24.32 
 
 		 539 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.73 
 
 		 437 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.51 
 
 		 372 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.62 
 
 		 365 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.91 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.8 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  42.11 
 
 		 96 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  42.11 
 
 		 96 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2109  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30 
 
 		 411 aa  55.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  42.11 
 
 		 96 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  42.11 
 
 		 96 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.28 
 
 		 408 aa  55.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.08 
 
 		 346 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.58 
 
 		 336 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32110  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer component  43.84 
 
 		 337 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3163  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.62 
 
 		 336 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141012  normal  0.450185 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.19 
 
 		 407 aa  53.9  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>