168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0712 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0712  CheD  100 
 
 		 157 aa  313  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  69.43 
 
 		 166 aa  223  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  56.05 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  55.7 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  54.43 
 
 		 167 aa  167  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  47.13 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  48.67 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  47.13 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.33 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.33 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.71 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  42.04 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.92 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  46.31 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  42.04 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.29 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  42.04 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.27 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  39.74 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  39.47 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  41.72 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  43.42 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  42.47 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  39.07 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.38 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.26 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  38 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  39.61 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.79 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  36.67 
 
 		 173 aa  104  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  37.33 
 
 		 205 aa  104  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.49 
 
 		 172 aa  104  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.42 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  37.66 
 
 		 162 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.64 
 
 		 220 aa  95.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.14 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.14 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  40.13 
 
 		 173 aa  94  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.84 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0431  hypothetical protein  40.56 
 
 		 173 aa  92  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.13773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  37.25 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.11 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  33.54 
 
 		 175 aa  90.1  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.94 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.18 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  32.89 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  36.18 
 
 		 159 aa  87  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.76 
 
 		 163 aa  87  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.03 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.25 
 
 		 171 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.03 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.03 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3212  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.29 
 
 		 212 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.03 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.03 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.03 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.03 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.03 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.84 
 
 		 194 aa  85.1  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.62 
 
 		 247 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.62 
 
 		 247 aa  84  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.62 
 
 		 247 aa  84  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3362  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.93 
 
 		 241 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0905  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.1 
 
 		 173 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  31.43 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  29.86 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.77 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.14 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.11 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0782  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.82 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1782  CheD  30.43 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.544534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1147  chemotaxis protein  31.21 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.332567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2970  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.14 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3810  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.16 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0123  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.46 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0284  hypothetical protein  31.08 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1321  CheD, stimulates methylation of MCP protein  33.33 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.776014  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.25 
 
 		 253 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  28.38 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.1 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  32.84 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0877  hypothetical protein  30.52 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0303  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.33 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00198735  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2326  chemotaxis protein CheD, putative  33.33 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0909  chemotaxis protein CheD, putative  32.35 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2630  chemotaxis protein  31.97 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  31.97 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2983  CheD, stimulates methylation of MCP protein  31.54 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0186  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.56 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0648  hypothetical protein  31.01 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0642567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1103  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.56 
 
 		 199 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.93 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2701  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.16 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.93 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.33 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  30.28 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4071  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.88 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>