297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2915 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  72.92 
 
 		 158 aa  217  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  72.92 
 
 		 146 aa  217  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3355  NUDIX hydrolase  63.1 
 
 		 84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.595371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1537  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  normal  0.0457282 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  32.74 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  35.64 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  35.29 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  35.64 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  41.98 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  41.98 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  41.98 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  35.64 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  35.64 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  35.64 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  40.52 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  35.64 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 299 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03840  ADP-ribose pyrophosphatase  38.04 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 209 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.85 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  36.56 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  47.69 
 
 		 383 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 205 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  32.97 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  26.76 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  26.53 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  29.41 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4142  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0751  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 		 205 aa  48.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5820  hypothetical protein  34.12 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 		 205 aa  48.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  24.66 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  30.3 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  25.85 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  37.11 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  29.41 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 341 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  26.5 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  26.76 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  24.66 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  35.29 
 
 		 336 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  24.29 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  34.57 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 282 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  31.08 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>