252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0422 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  100 
 
 
216 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  76.39 
 
 
216 aa  343  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  57.14 
 
 
232 aa  248  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  54.46 
 
 
215 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  50.93 
 
 
217 aa  225  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  53.55 
 
 
215 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  50.95 
 
 
214 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  45.79 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  45.75 
 
 
215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  45.28 
 
 
215 aa  181  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  45.28 
 
 
215 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  45.79 
 
 
215 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  45.33 
 
 
215 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  45.75 
 
 
215 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  45.75 
 
 
215 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  45.28 
 
 
215 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  45.75 
 
 
215 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  42.86 
 
 
215 aa  160  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  42.86 
 
 
215 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  42.79 
 
 
205 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  42.79 
 
 
205 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  42.79 
 
 
205 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  42.79 
 
 
205 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  41.4 
 
 
214 aa  158  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  44.71 
 
 
205 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  42.86 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  43.69 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  43.2 
 
 
220 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  39.52 
 
 
223 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  41.83 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  41.87 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  41.79 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  38.28 
 
 
204 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  39.9 
 
 
206 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  38.76 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  40.38 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  45.23 
 
 
208 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  41.35 
 
 
206 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  41.35 
 
 
206 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  41.35 
 
 
206 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  44.44 
 
 
257 aa  145  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  38.76 
 
 
205 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  44.44 
 
 
213 aa  144  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  38.5 
 
 
214 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  35.89 
 
 
230 aa  143  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  38.28 
 
 
205 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  41.83 
 
 
206 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  41.83 
 
 
206 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  41.83 
 
 
205 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  37.32 
 
 
205 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  40.87 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  40.38 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  41.92 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  39.9 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  39.9 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  39.9 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  37.8 
 
 
205 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0117  membrane protein  41.71 
 
 
233 aa  139  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  39.9 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  39.9 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  39.9 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  39.9 
 
 
206 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  40.58 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  40.89 
 
 
214 aa  138  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  41.75 
 
 
221 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  40.39 
 
 
214 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  40.28 
 
 
215 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  44.17 
 
 
221 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  40.69 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  41.83 
 
 
205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  38.94 
 
 
206 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  39.05 
 
 
220 aa  134  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  38.86 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  39.05 
 
 
216 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  38.79 
 
 
215 aa  131  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  37.26 
 
 
268 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  39.34 
 
 
239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  39.34 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  39.34 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  39.34 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  39.34 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  39.34 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  38.21 
 
 
221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  38.46 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  39.34 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  41.83 
 
 
205 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  37.89 
 
 
366 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  36.32 
 
 
208 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  38.39 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  38.39 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  38.86 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  39.59 
 
 
262 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5210  HylII  41.83 
 
 
205 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  35.98 
 
 
216 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  42.16 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  40.7 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  39.25 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  37.62 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  36.71 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  41.18 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>