More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0221 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  81 
 
 		 220 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  79.19 
 
 		 219 aa  355  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  73.64 
 
 		 218 aa  349  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  78.57 
 
 		 219 aa  345  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  71.82 
 
 		 220 aa  338  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  70.45 
 
 		 222 aa  335  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  72.77 
 
 		 226 aa  335  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  71.49 
 
 		 221 aa  330  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  71.23 
 
 		 214 aa  328  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  70.05 
 
 		 218 aa  320  8e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  68.66 
 
 		 218 aa  317  9e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  68.02 
 
 		 222 aa  314  6e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  67.87 
 
 		 219 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  67.62 
 
 		 229 aa  311  5.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  66.2 
 
 		 226 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  66.2 
 
 		 222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  66.2 
 
 		 222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  66.52 
 
 		 219 aa  304  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  66.06 
 
 		 219 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  66.06 
 
 		 219 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  66.06 
 
 		 219 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  66.06 
 
 		 219 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  66.06 
 
 		 219 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  66.06 
 
 		 219 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  66.06 
 
 		 219 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  66.06 
 
 		 219 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  66.06 
 
 		 219 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  65.55 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  65.88 
 
 		 224 aa  302  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  65.88 
 
 		 224 aa  302  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  64.41 
 
 		 224 aa  302  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  65.88 
 
 		 224 aa  302  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  70.42 
 
 		 227 aa  301  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  66.51 
 
 		 210 aa  300  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  64.59 
 
 		 210 aa  300  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  64.62 
 
 		 211 aa  298  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 210 aa  299  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  64.62 
 
 		 211 aa  298  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  63.18 
 
 		 221 aa  298  5e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  63.89 
 
 		 222 aa  296  1e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  64.22 
 
 		 217 aa  295  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  63.16 
 
 		 211 aa  295  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  62.86 
 
 		 210 aa  293  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  64.65 
 
 		 245 aa  291  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 219 aa  291  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  64.9 
 
 		 236 aa  290  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  61.01 
 
 		 217 aa  290  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  61.01 
 
 		 217 aa  290  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  63.81 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  63.76 
 
 		 217 aa  290  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 223 aa  289  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  60.55 
 
 		 217 aa  288  7e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  65.09 
 
 		 217 aa  286  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  61.86 
 
 		 223 aa  286  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  60.58 
 
 		 210 aa  286  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  62.74 
 
 		 262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  59.07 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  61.54 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  61.79 
 
 		 260 aa  281  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  58.14 
 
 		 239 aa  281  8.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  57.71 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0411  30S ribosomal protein S3  56.88 
 
 		 234 aa  279  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000407392  normal  0.239149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  59.53 
 
 		 216 aa  279  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  61.54 
 
 		 236 aa  278  5e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  61.54 
 
 		 236 aa  278  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  58.48 
 
 		 234 aa  278  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  58.74 
 
 		 236 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 236 aa  277  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 244 aa  277  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  61.17 
 
 		 270 aa  277  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  61.54 
 
 		 232 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  60.19 
 
 		 227 aa  277  9e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 238 aa  277  9e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  60.19 
 
 		 227 aa  277  9e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  61.72 
 
 		 233 aa  277  9e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 238 aa  277  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  59.11 
 
 		 235 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  57.59 
 
 		 223 aa  277  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 252 aa  276  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  62.8 
 
 		 278 aa  277  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  57.92 
 
 		 226 aa  276  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 238 aa  275  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 232 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 232 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 272 aa  275  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  60.68 
 
 		 288 aa  275  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 341 aa  275  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  55.05 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  60.39 
 
 		 278 aa  275  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  58.41 
 
 		 228 aa  274  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  59.36 
 
 		 228 aa  274  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  59.36 
 
 		 228 aa  274  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>