More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_999 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  98.68 
 
 		 607 aa  1220    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  93.74 
 
 		 607 aa  1165    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 607 aa  1237    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  45.79 
 
 		 641 aa  549  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  45.75 
 
 		 624 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  44.22 
 
 		 607 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  44.72 
 
 		 653 aa  533  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  45.82 
 
 		 613 aa  534  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  43.84 
 
 		 613 aa  525  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  44.16 
 
 		 588 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  42.93 
 
 		 625 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 		 615 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  41.31 
 
 		 669 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  41.72 
 
 		 665 aa  488  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  42.13 
 
 		 614 aa  485  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  43.12 
 
 		 604 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  40.8 
 
 		 685 aa  487  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  41.42 
 
 		 620 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  41.42 
 
 		 620 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 		 613 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  40.98 
 
 		 611 aa  472  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  41.71 
 
 		 638 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  42.06 
 
 		 617 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  42.06 
 
 		 617 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  41.37 
 
 		 647 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  40.13 
 
 		 601 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  39.51 
 
 		 708 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 		 628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  40.75 
 
 		 636 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  39.48 
 
 		 677 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  41.44 
 
 		 613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  40.53 
 
 		 598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  42.11 
 
 		 622 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  36.98 
 
 		 671 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  40.46 
 
 		 613 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  39.18 
 
 		 656 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  40.92 
 
 		 614 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  40.98 
 
 		 649 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  40.39 
 
 		 622 aa  445  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  40.81 
 
 		 623 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  39.18 
 
 		 612 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  40.46 
 
 		 617 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  40.85 
 
 		 625 aa  435  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  39.55 
 
 		 641 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  40.35 
 
 		 617 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  39.77 
 
 		 607 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  37.12 
 
 		 649 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 627 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  38.26 
 
 		 649 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  39.54 
 
 		 624 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  38.44 
 
 		 643 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 		 643 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  40.39 
 
 		 604 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  37.48 
 
 		 675 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  37.56 
 
 		 646 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  38.41 
 
 		 626 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  40.03 
 
 		 704 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  40.03 
 
 		 628 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 658 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  36.69 
 
 		 674 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.51 
 
 		 610 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 593 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  37.88 
 
 		 684 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  38.67 
 
 		 691 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  38.51 
 
 		 690 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 		 639 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  37.9 
 
 		 612 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  36.81 
 
 		 658 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  39.22 
 
 		 653 aa  418  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 631 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  36.47 
 
 		 678 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  39.15 
 
 		 619 aa  415  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  39.17 
 
 		 594 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  39.48 
 
 		 623 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  39.48 
 
 		 623 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  38.96 
 
 		 634 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  38.97 
 
 		 680 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 		 631 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  36.47 
 
 		 604 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  39.44 
 
 		 623 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  38.51 
 
 		 626 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  39.38 
 
 		 642 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 		 690 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  39.17 
 
 		 594 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  39.17 
 
 		 594 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  39.17 
 
 		 594 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  39.17 
 
 		 594 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1115  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 		 679 aa  412  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.86041  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  39.17 
 
 		 594 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0918  excinuclease ABC subunit C  39.26 
 
 		 652 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.312337  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  39.26 
 
 		 680 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 		 676 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  36.7 
 
 		 616 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  39.12 
 
 		 690 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  35.62 
 
 		 665 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 		 678 aa  412  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  35.54 
 
 		 679 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  36.01 
 
 		 660 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  37.28 
 
 		 666 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 		 676 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>