More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4344 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 387 aa  776    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  51.55 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  49.74 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  48.7 
 
 		 412 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  46.02 
 
 		 378 aa  336  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  48.06 
 
 		 388 aa  332  9e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  47.53 
 
 		 377 aa  322  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  45.22 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  41.71 
 
 		 379 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  41.56 
 
 		 365 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  39.85 
 
 		 366 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  40.64 
 
 		 421 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  42.66 
 
 		 417 aa  246  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  40.15 
 
 		 369 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  37.95 
 
 		 366 aa  246  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  40.16 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  40.16 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  38.96 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 		 366 aa  243  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  39.73 
 
 		 368 aa  242  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  38.3 
 
 		 369 aa  242  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  42.9 
 
 		 426 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  39.68 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  39.07 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  38.69 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  40.11 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  40.59 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  41.19 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  40.59 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  38.77 
 
 		 398 aa  235  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  43.3 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  43.3 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  40.88 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  38.62 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  38.62 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  38.62 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  40.96 
 
 		 368 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  41.47 
 
 		 368 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  40.96 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  40.96 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  40.96 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  35.71 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  42.68 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  39.61 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  40.52 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  40.36 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  37.6 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  38.9 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  38.9 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  38.9 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  39.85 
 
 		 380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  42.07 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 382 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  39.02 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  38.38 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.42 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  38.76 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  37.81 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  38.38 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  37.43 
 
 		 374 aa  222  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  37.98 
 
 		 382 aa  222  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  41.47 
 
 		 368 aa  222  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  40.9 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0166  rod shape-determining protein RodA  38.9 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0158  rod shape-determining protein RodA  38.9 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  40.9 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  39.19 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0177  rod shape-determining protein RodA  38.9 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2290  rod shape-determining protein RodA  38.9 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  40.1 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2789  rod shape-determining protein RodA  38.9 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2370  rod shape-determining protein RodA  38.9 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3686  rod shape-determining protein RodA  42.13 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0063  rod shape-determining (RODA protein) transmembrane  40.62 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913941  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3363  rod shape-determining protein RodA  41.88 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0362  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  37.7 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  40 
 
 		 368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  38.76 
 
 		 373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0142  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 382 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  37.76 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  39.27 
 
 		 380 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  38.13 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  38.73 
 
 		 372 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  38.08 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  36.69 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  34.84 
 
 		 363 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3111  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  38.01 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  43.25 
 
 		 386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  35.81 
 
 		 373 aa  215  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  40.32 
 
 		 371 aa  216  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  37.47 
 
 		 370 aa  215  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  41.19 
 
 		 366 aa  215  9e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>