More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4974 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  62.96 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  50 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  52.74 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  47.9 
 
 		 204 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  44 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  43.52 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  42.94 
 
 		 194 aa  146  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  45.24 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  48.25 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  33.98 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  32.69 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  34.13 
 
 		 223 aa  112  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  31.75 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  41.48 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  39.04 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  33.8 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  38.95 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  43.07 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  40.26 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  34.52 
 
 		 246 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 		 195 aa  101  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  35.67 
 
 		 190 aa  101  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  38.62 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  35.37 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  31.78 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  38.3 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  35.71 
 
 		 225 aa  98.2  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  38 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  35.86 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  38.93 
 
 		 282 aa  97.1  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  36.3 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  35.44 
 
 		 183 aa  95.9  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  35.25 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  38.1 
 
 		 180 aa  95.5  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  32.04 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  32.22 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  35.1 
 
 		 286 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  40.13 
 
 		 185 aa  94.7  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.35 
 
 		 243 aa  94.7  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  31.79 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.9 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  35.51 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  35.51 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  30.95 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  32.93 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  33.99 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  33.81 
 
 		 259 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  36.3 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  34.46 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  32.43 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  32.19 
 
 		 224 aa  91.7  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  34.06 
 
 		 259 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  36.3 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  31.08 
 
 		 247 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  35.12 
 
 		 191 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  37.86 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  34.78 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  34.69 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.77 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  35.85 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  32.32 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  36.3 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  38.97 
 
 		 169 aa  88.2  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  38.24 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  32.82 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  36.76 
 
 		 174 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  31.18 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.96 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  36.36 
 
 		 184 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  35.25 
 
 		 173 aa  85.9  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  32.35 
 
 		 184 aa  85.9  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  34.76 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  35.77 
 
 		 201 aa  85.5  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 204 aa  85.1  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  30.97 
 
 		 187 aa  84.7  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  38.36 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  31.98 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  38.73 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  31.06 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  31.61 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  32.97 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  31.95 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  33.55 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  36.03 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  34.03 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>