More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1399 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 300 aa  596  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.55 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  42.91 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  38.38 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  39.05 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  38.21 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.89 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  28.12 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.33 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.84 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  28.01 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  27.17 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.45 
 
 		 274 aa  85.9  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  28.67 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  30.4 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.11 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  26.95 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  25.48 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  25.9 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.42 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  24.25 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.18 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  25.49 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  27.36 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  25.36 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  28.85 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  27.56 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.64 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.28 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  27.68 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  25.87 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  26.73 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1225  hypothetical protein  26.41 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000294223  normal  0.640031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.43 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.19 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27.06 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  23.45 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.28 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  25.84 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  23.28 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  25.84 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  28.14 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  25.89 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  27.64 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  20.93 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  25.87 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  23.97 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  26.41 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.46 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.34 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  26 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.23 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  24.41 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  22.46 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  24.9 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  23.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  20.82 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  26.56 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  25.17 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.17 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.23 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.17 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.17 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.17 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  24.24 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  24.24 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.17 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  26.94 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.17 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  25.17 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  24.5 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.99 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  22.11 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.17 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.56 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.56 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.56 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.56 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  25.5 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  25.5 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  26.56 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>