250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0742 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  100 
 
 
547 aa  1085    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.86 
 
 
1679 aa  300  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  47.09 
 
 
821 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  45.97 
 
 
818 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  36.2 
 
 
461 aa  252  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  36.81 
 
 
911 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.78 
 
 
1919 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  36.99 
 
 
461 aa  239  9e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  37.47 
 
 
807 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  37.56 
 
 
449 aa  209  8e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  37.94 
 
 
2082 aa  203  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  36.78 
 
 
717 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  31.97 
 
 
743 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  36.92 
 
 
714 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.25 
 
 
692 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.87 
 
 
469 aa  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  29.58 
 
 
363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  29.58 
 
 
363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  34.36 
 
 
1129 aa  147  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  33.16 
 
 
784 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  33.42 
 
 
778 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  33.42 
 
 
792 aa  143  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  33.16 
 
 
776 aa  143  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  34.27 
 
 
593 aa  143  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  37.79 
 
 
376 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  50 
 
 
1222 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  31.87 
 
 
726 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.76 
 
 
1848 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.52 
 
 
563 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.58 
 
 
555 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  37.89 
 
 
1126 aa  127  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  33.05 
 
 
546 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.43 
 
 
417 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.96 
 
 
561 aa  123  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.75 
 
 
837 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  34.48 
 
 
835 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.28 
 
 
810 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  38.38 
 
 
681 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.59 
 
 
706 aa  120  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.7 
 
 
555 aa  117  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  31.76 
 
 
551 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  32.84 
 
 
477 aa  116  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  33.56 
 
 
558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  33.89 
 
 
569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  33 
 
 
554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.09 
 
 
553 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  31.09 
 
 
737 aa  112  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  33.58 
 
 
553 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  30.9 
 
 
558 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  32.43 
 
 
597 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  31.37 
 
 
443 aa  107  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.77 
 
 
567 aa  106  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  32.14 
 
 
554 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.13 
 
 
556 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  32.22 
 
 
579 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.24 
 
 
817 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  31.79 
 
 
577 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  34.18 
 
 
560 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.87 
 
 
570 aa  98.6  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  29.87 
 
 
624 aa  94.4  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  25.9 
 
 
396 aa  93.2  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  29.1 
 
 
575 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  30.03 
 
 
403 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.33 
 
 
787 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  28.17 
 
 
328 aa  92.8  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  28.97 
 
 
618 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  30.23 
 
 
341 aa  90.9  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  29.09 
 
 
418 aa  89.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  28.74 
 
 
399 aa  88.2  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.65 
 
 
900 aa  87.4  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  42.98 
 
 
483 aa  87.4  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  31.77 
 
 
566 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  41.44 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  45.05 
 
 
452 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.8 
 
 
454 aa  84  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  43.14 
 
 
259 aa  84  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  35.56 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.93 
 
 
941 aa  83.6  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  44.79 
 
 
480 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  29 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  25.88 
 
 
643 aa  80.9  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  45.57 
 
 
106 aa  80.5  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  43.14 
 
 
216 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  27.08 
 
 
1187 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  39.29 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  45 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  36.7 
 
 
948 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  41.23 
 
 
113 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 
745 aa  77.4  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.36 
 
 
921 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  32.43 
 
 
389 aa  77  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  26.23 
 
 
390 aa  77  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.62 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  27.82 
 
 
643 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  28.03 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  30.04 
 
 
544 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  30.15 
 
 
727 aa  75.1  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  29.45 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  43.4 
 
 
732 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  28.85 
 
 
1312 aa  75.5  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>