154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0178 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  81.34 
 
 		 127 aa  225  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  81.34 
 
 		 127 aa  226  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  58.68 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  58.47 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  54.39 
 
 		 135 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  55.93 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  47.41 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  48.7 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  47.83 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  44.54 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  47.06 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  45.45 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  36.94 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  44.12 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  41.28 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  36.67 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  36.21 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  37.3 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  37.17 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  34.55 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  42.39 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  39.25 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  37.61 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  36.45 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  34.17 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  32.43 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  31.43 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  38.46 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  33.64 
 
 		 321 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  27.36 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  38 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  31.4 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  35.14 
 
 		 319 aa  62  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  37.19 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  30.58 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  32.06 
 
 		 311 aa  60.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  32.11 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  30.91 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  30.58 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  39.36 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  35.42 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  31.4 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  28.57 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  37.76 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  35.11 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  32.04 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  35.85 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  32.73 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  35.16 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  35.16 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  35.16 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  35.16 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  35.16 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  35.16 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  34.23 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  31.07 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  37.84 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  34.58 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  33.91 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  30.58 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  35.04 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  37.84 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  42.47 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  37.84 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  35.04 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  38.95 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  35.04 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  30.1 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  38.96 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  32.46 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  33.98 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  25.45 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  43.48 
 
 		 333 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  36.44 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  31.82 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  30.84 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  31.25 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  36.56 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  36.67 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  31.97 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  36.19 
 
 		 315 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  31.78 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  23.14 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  30.91 
 
 		 541 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  28.97 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  38.32 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  33.01 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  26.98 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  32.95 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  31.25 
 
 		 417 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  31.73 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  35.56 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>