More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0101 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
1033 aa  2143    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  48.84 
 
 
1074 aa  999    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  90.5 
 
 
1070 aa  1961    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  93.8 
 
 
1070 aa  2019    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  51.28 
 
 
1084 aa  1055    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  35.27 
 
 
934 aa  569  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  29.88 
 
 
992 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  32.61 
 
 
1031 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  32 
 
 
1087 aa  438  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  30.46 
 
 
1038 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  29.77 
 
 
1020 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  30.06 
 
 
1020 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  29.58 
 
 
1020 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  29.68 
 
 
1020 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  29.68 
 
 
1020 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  29.22 
 
 
1029 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  28.9 
 
 
1027 aa  383  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  29.92 
 
 
1011 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  28.22 
 
 
1030 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  28.98 
 
 
1022 aa  379  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  29.16 
 
 
1066 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  29.23 
 
 
1064 aa  359  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  29.14 
 
 
1064 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  28.37 
 
 
1035 aa  352  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  27.65 
 
 
1173 aa  346  2e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  27.99 
 
 
1035 aa  345  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  27.38 
 
 
1035 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  27.38 
 
 
1035 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  27.37 
 
 
1035 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  27.49 
 
 
1035 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  27.26 
 
 
1036 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  28.12 
 
 
996 aa  327  6e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  26.77 
 
 
1012 aa  271  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  26.04 
 
 
1026 aa  270  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  27.09 
 
 
1012 aa  270  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  26.46 
 
 
1024 aa  266  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  24.73 
 
 
856 aa  99.4  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  22.94 
 
 
866 aa  97.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  25.84 
 
 
812 aa  97.1  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  24.69 
 
 
817 aa  94.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  25.22 
 
 
974 aa  93.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.25 
 
 
953 aa  90.9  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3051  molybdopterin oxidoreductase  24.88 
 
 
822 aa  90.9  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333722  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  23.17 
 
 
978 aa  89.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.06 
 
 
978 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  24.06 
 
 
973 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 
978 aa  89.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  24.06 
 
 
973 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  23.88 
 
 
833 aa  89.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  23.74 
 
 
969 aa  89  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.06 
 
 
978 aa  88.2  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  24.06 
 
 
973 aa  88.2  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.06 
 
 
973 aa  88.2  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.06 
 
 
973 aa  88.2  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  24.4 
 
 
974 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  24.03 
 
 
978 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  22.85 
 
 
981 aa  85.9  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  21.77 
 
 
974 aa  85.1  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  29.84 
 
 
826 aa  85.1  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.09 
 
 
923 aa  81.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  24.18 
 
 
879 aa  80.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.19 
 
 
973 aa  80.1  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  23.86 
 
 
958 aa  79.7  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  25.6 
 
 
961 aa  79.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.39 
 
 
935 aa  77.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  21.24 
 
 
826 aa  77  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  25.16 
 
 
1058 aa  76.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  23.31 
 
 
979 aa  76.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  26.87 
 
 
898 aa  76.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  23.63 
 
 
968 aa  76.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  22.99 
 
 
879 aa  75.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  21.27 
 
 
858 aa  75.5  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  23 
 
 
818 aa  74.7  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  24.12 
 
 
817 aa  73.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.54 
 
 
981 aa  73.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.93 
 
 
836 aa  72.8  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  36.27 
 
 
759 aa  72.8  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  25.87 
 
 
805 aa  72.4  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  25.47 
 
 
876 aa  72.4  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  34.65 
 
 
910 aa  71.6  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  25.43 
 
 
1065 aa  72  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  24.24 
 
 
805 aa  71.2  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.34 
 
 
928 aa  71.2  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  22.89 
 
 
781 aa  70.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  25.05 
 
 
932 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  23.3 
 
 
821 aa  70.1  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.91 
 
 
864 aa  70.1  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  21.83 
 
 
695 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  25.57 
 
 
811 aa  68.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  25.67 
 
 
927 aa  68.6  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  25.24 
 
 
916 aa  68.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  32.38 
 
 
757 aa  68.6  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  27.15 
 
 
750 aa  68.6  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  25.24 
 
 
909 aa  68.6  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  27.39 
 
 
808 aa  68.2  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  25.73 
 
 
938 aa  67.8  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  27.93 
 
 
747 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.81 
 
 
942 aa  67.4  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  25.48 
 
 
760 aa  67  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  23.08 
 
 
928 aa  66.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>