More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1713 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  100 
 
 
224 aa  457  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  99.11 
 
 
224 aa  453  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  67.28 
 
 
219 aa  311  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  63.89 
 
 
222 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  61.88 
 
 
226 aa  285  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  62.1 
 
 
222 aa  280  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  56.95 
 
 
228 aa  255  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  53 
 
 
221 aa  225  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  44.95 
 
 
225 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  41.63 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  42.58 
 
 
211 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  41.01 
 
 
213 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  40.95 
 
 
211 aa  168  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  40.55 
 
 
213 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  43.22 
 
 
199 aa  164  8e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  43.84 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  44.04 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  42.35 
 
 
190 aa  157  8e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  42.16 
 
 
234 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  44.66 
 
 
228 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  45.54 
 
 
228 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  40.74 
 
 
235 aa  153  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  46.83 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  35.16 
 
 
219 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  44.88 
 
 
228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  35.62 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  44.88 
 
 
228 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  44.39 
 
 
228 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  44.88 
 
 
228 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  40.89 
 
 
241 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  37.89 
 
 
231 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  39.9 
 
 
255 aa  148  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  37.56 
 
 
219 aa  148  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  37.89 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  41.46 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  37.19 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  41.26 
 
 
239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.37 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  44.12 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  40.78 
 
 
229 aa  145  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  37.85 
 
 
231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  40.69 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  41.71 
 
 
226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.98 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  40.48 
 
 
239 aa  145  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  40.78 
 
 
232 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  38.92 
 
 
226 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  38.92 
 
 
225 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  37.44 
 
 
242 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  41.5 
 
 
235 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  37.56 
 
 
219 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  40.78 
 
 
232 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  39.65 
 
 
232 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  39.57 
 
 
237 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  42.11 
 
 
229 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  40.89 
 
 
232 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  37.05 
 
 
227 aa  141  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  40.09 
 
 
235 aa  141  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  40.29 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  40.93 
 
 
236 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  39.72 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  37.93 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  37.62 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  40.48 
 
 
229 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  38.16 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  41.46 
 
 
231 aa  138  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  38.65 
 
 
232 aa  138  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  35.92 
 
 
236 aa  138  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  37.33 
 
 
220 aa  138  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2922  alanine racemase domain protein  40.38 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  38.65 
 
 
271 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  36.54 
 
 
244 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  35 
 
 
220 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  39 
 
 
202 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  39.52 
 
 
229 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  38.61 
 
 
224 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  38.98 
 
 
237 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  39.9 
 
 
235 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 
241 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  41.38 
 
 
228 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  37.55 
 
 
233 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  37.02 
 
 
241 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  36.41 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  35.81 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  36.1 
 
 
233 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  36.63 
 
 
230 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  37.55 
 
 
224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.73 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  38.05 
 
 
239 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  34.55 
 
 
219 aa  134  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  39.11 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  34.38 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  37 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  37.62 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  37.74 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  39.9 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  43.63 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  43.63 
 
 
230 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>