73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4770 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 399 aa  821    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  37.11 
 
 		 410 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  28.61 
 
 		 386 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 410 aa  99.4  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  25.56 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2374  transcriptional regulator  72.58 
 
 		 68 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0320112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  24.02 
 
 		 342 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  26.3 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  26.15 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  24.71 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  26.25 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  23.76 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  24.81 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  25.52 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  24.4 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  30.72 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  30.19 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  28.76 
 
 		 255 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  23.91 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  22.97 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  24.52 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  25.25 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  23.64 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  26.77 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  24.34 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  23.9 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  26.35 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  31.41 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  24.25 
 
 		 357 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  24.79 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  25.67 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  25.73 
 
 		 257 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  27.27 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  22.68 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  23.54 
 
 		 386 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  25 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  24.91 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 84 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  25.56 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  25.82 
 
 		 283 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4169  helix-turn-helix domain protein  22.98 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00295679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4067  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 		 125 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.563451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 111 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  25.13 
 
 		 251 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  23.28 
 
 		 356 aa  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  23.34 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  24.58 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  23.15 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 112 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  24.86 
 
 		 350 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  22.19 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  24.29 
 
 		 273 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 192 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  25.47 
 
 		 216 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  23 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 		 122 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  25.5 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  26.75 
 
 		 261 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  27.23 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 139 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 503 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  25.82 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 195 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  24.69 
 
 		 216 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  24.84 
 
 		 216 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 380 aa  43.1  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  29.27 
 
 		 285 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 505 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>