73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1704 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  100 
 
 		 391 aa  821    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  48.66 
 
 		 395 aa  346  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  40.36 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  39.35 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  32.49 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  34.73 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  31.23 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  30.29 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  29.23 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  30.35 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3943  putative integrase  36.54 
 
 		 209 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  32.43 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2577  integrase  33.82 
 
 		 216 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.922481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  26.35 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  39.1 
 
 		 147 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  32.3 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  24.91 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  24.91 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  24.91 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  25.67 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  25.94 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  24.77 
 
 		 357 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  27.32 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  23.46 
 
 		 412 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  21.43 
 
 		 356 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2948  phage integrase family protein  25.38 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.245943 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  27.95 
 
 		 452 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  24.55 
 
 		 315 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.19 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  25.28 
 
 		 426 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 401 aa  50.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  22.52 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  26.77 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  24.9 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25.52 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  31.73 
 
 		 571 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  28.97 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  25.66 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  25.48 
 
 		 550 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  23.22 
 
 		 471 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  23.19 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  22.41 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  23.42 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  21.83 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  23.75 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  22.65 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  31.52 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  23.89 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.26 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  21.16 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  22.27 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.88 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  22.22 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.01 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  27.1 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  23.22 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  23.05 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  21.71 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  22.02 
 
 		 304 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  23.58 
 
 		 286 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.4 
 
 		 376 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0175  integrase family protein  28.81 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.4 
 
 		 376 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  22.07 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>