More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5129 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.52 
 
 
255 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.92 
 
 
255 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.52 
 
 
255 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  51.59 
 
 
252 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  51.59 
 
 
252 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  51.19 
 
 
252 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  50.79 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  49.6 
 
 
252 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  49.6 
 
 
252 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  49.21 
 
 
252 aa  228  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  49.21 
 
 
252 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  49.21 
 
 
252 aa  225  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  47.43 
 
 
257 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  47.97 
 
 
257 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  47.97 
 
 
254 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  49.59 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  48.37 
 
 
254 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  47.04 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  46.75 
 
 
254 aa  214  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  47.15 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  47.15 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  46.34 
 
 
254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
253 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
254 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
252 aa  188  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
252 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
253 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
254 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
247 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
250 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
259 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
254 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
254 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
254 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
246 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
261 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  40.3 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
255 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
243 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
257 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 
253 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
256 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  46.22 
 
 
254 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  39.68 
 
 
254 aa  168  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
254 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
253 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
257 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
247 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
247 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
253 aa  162  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
259 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
250 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
251 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
251 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
251 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.87 
 
 
247 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
243 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
252 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  39.27 
 
 
252 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
246 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
251 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.8 
 
 
247 aa  159  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
247 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
251 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
248 aa  158  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
251 aa  158  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 
246 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
251 aa  158  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
245 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
248 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
248 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.54 
 
 
246 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.92 
 
 
269 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
242 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0957  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
248 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 
247 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.25 
 
 
249 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
250 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>