More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3751 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  100 
 
 		 395 aa  832    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  41.93 
 
 		 415 aa  289  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  39.61 
 
 		 403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  42.99 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  40.32 
 
 		 410 aa  249  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  36.31 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  35.33 
 
 		 848 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  32.32 
 
 		 381 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  32.77 
 
 		 510 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  32.9 
 
 		 356 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.44 
 
 		 442 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  32.21 
 
 		 445 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  34.52 
 
 		 578 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  33.02 
 
 		 487 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  33.33 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  29.89 
 
 		 422 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  33.33 
 
 		 446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.94 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30.94 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  32.11 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  34.35 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  31.34 
 
 		 369 aa  143  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  31.88 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  31.52 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  29.46 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  30.16 
 
 		 434 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  29.97 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.84 
 
 		 537 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  32.01 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  28.62 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.9 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.91 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  29.91 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.9 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  27.78 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.53 
 
 		 593 aa  127  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  27.14 
 
 		 413 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.63 
 
 		 559 aa  126  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.45 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  30.03 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  30.03 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  28.74 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  28.66 
 
 		 363 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.89 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.94 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  28.91 
 
 		 370 aa  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  27.35 
 
 		 415 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.45 
 
 		 385 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  29.94 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.74 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  28.99 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.57 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  27.74 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  28.03 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  29.03 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  28.45 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.46 
 
 		 603 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  30.03 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.41 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.84 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  29.03 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.09 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.48 
 
 		 611 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  29.62 
 
 		 375 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  28.81 
 
 		 378 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  30.36 
 
 		 379 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  29.23 
 
 		 378 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.37 
 
 		 582 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.51 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  26.3 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  29.8 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  31.29 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  27.9 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  27.9 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  32.87 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 341 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  27.9 
 
 		 388 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  31.92 
 
 		 340 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.9 
 
 		 388 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.9 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  29.77 
 
 		 507 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  29.45 
 
 		 388 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  33.94 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  30.66 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  31.78 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  30.65 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  29.09 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  29.97 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.49 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  31.4 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  28.62 
 
 		 378 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>