More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2104 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  100 
 
 		 455 aa  888    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  70.29 
 
 		 451 aa  598  1e-170  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  58.71 
 
 		 462 aa  509  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  45.39 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  45.95 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  44.24 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  45.11 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  45.55 
 
 		 452 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  44.99 
 
 		 452 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  44.99 
 
 		 452 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  44.84 
 
 		 452 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  45.41 
 
 		 452 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  44.98 
 
 		 452 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  44.98 
 
 		 452 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  43.94 
 
 		 452 aa  352  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  44.98 
 
 		 452 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  45.95 
 
 		 452 aa  346  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  42.99 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  45.51 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  45.51 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  43.76 
 
 		 450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  42.89 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  41.63 
 
 		 455 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  42.48 
 
 		 447 aa  330  4e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  41.61 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  43.37 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  44.9 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  38.51 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  42.86 
 
 		 447 aa  309  8e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  40.49 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  40.53 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  39.21 
 
 		 452 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  42.5 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  38.81 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  35.2 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  35.85 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  34.95 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  35.5 
 
 		 461 aa  229  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  34.92 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  34.67 
 
 		 468 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  30.93 
 
 		 477 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  30.79 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  32.58 
 
 		 464 aa  193  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  33.11 
 
 		 498 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  33.11 
 
 		 498 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  33.11 
 
 		 498 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  33.11 
 
 		 498 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  33.11 
 
 		 498 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  35.61 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  32.33 
 
 		 487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  31.38 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3385  gluconate permease  30.89 
 
 		 441 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.545064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3408  gluconate permease  30.89 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3410  gluconate permease  30.67 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3162  gluconate permease  30.67 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3831  gluconate transporter  31.84 
 
 		 474 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0228851  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  31.3 
 
 		 477 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3398  gluconate permease  30.67 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  31.3 
 
 		 477 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3079  gluconate permease  30.44 
 
 		 441 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  31.3 
 
 		 477 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  35 
 
 		 452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3178  gluconate permease  30.44 
 
 		 441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.128812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  31.07 
 
 		 449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3429  gluconate permease  30.44 
 
 		 441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.510493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  32.17 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  30.09 
 
 		 453 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1892  high-affinity H+/gluconate symporter  31.85 
 
 		 437 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328259  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  29.89 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  29.89 
 
 		 449 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  30.66 
 
 		 453 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  29.05 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  30.75 
 
 		 474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  30.8 
 
 		 458 aa  173  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  30.67 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  31.33 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  31.06 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  29.35 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  30.54 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  31.16 
 
 		 494 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  29.53 
 
 		 447 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  28.35 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  29.49 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  28.35 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4983  gluconate permease  31 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4684  gluconate transporter  31.22 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  29.53 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  29.4 
 
 		 447 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  28.8 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4998  gluconate permease  31 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4955  gluconate permease  30.35 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0265  gluconate permease  30.79 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  29.6 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  29.18 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4735  gluconate permease  30.35 
 
 		 441 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5095  gluconate permease  30.35 
 
 		 441 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  29.81 
 
 		 485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4594  gluconate permease  30.13 
 
 		 441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  28.36 
 
 		 485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  30.86 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>