More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0982 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 177 aa  366  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  63.89 
 
 		 182 aa  246  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  61.36 
 
 		 265 aa  234  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 		 192 aa  228  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  60.11 
 
 		 186 aa  227  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  51.1 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  39.11 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 184 aa  103  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 166 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 208 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  36.71 
 
 		 194 aa  84.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 		 191 aa  84.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 199 aa  77.4  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.08 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  35.44 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  35.44 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.44 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.44 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.44 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.44 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.44 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 215 aa  74.3  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3745  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  29.83 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  31.95 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 204 aa  72  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  30.71 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 211 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  33.53 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  32.78 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  28.09 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  40.82 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  28.22 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 281 aa  68.2  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  32.35 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 209 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  31.18 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 209 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>