More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0163 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  100 
 
 		 160 aa  335  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  83.23 
 
 		 157 aa  273  7e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  81.25 
 
 		 158 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  83.12 
 
 		 157 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  83.75 
 
 		 157 aa  271  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  81.25 
 
 		 156 aa  263  5.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  77.85 
 
 		 152 aa  249  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  44.14 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  38.94 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  38.94 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 156 aa  90.5  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  39.47 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  40 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  40.68 
 
 		 146 aa  88.2  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  39.25 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  45.37 
 
 		 141 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 166 aa  83.6  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  33.55 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 146 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  36.52 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  36.92 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  37.19 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  37.07 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  37.07 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  37.07 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  37.07 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  37.07 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  37.07 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  37.07 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  37.07 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  37.07 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  37.07 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  37.07 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  31.91 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  35.78 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  32.86 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  37.27 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  33.9 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  39.5 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  34.86 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  33.57 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  39.32 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1357  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  34.06 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  31.86 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  38.53 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  34.26 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  34.26 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  32.46 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  32.79 
 
 		 136 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  35.78 
 
 		 242 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  32.09 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  30.08 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  32.73 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  32.73 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  34.86 
 
 		 231 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 277 aa  70.5  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>