285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2026 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 358 aa  728    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  55.31 
 
 		 360 aa  421  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  55.59 
 
 		 359 aa  394  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  51.68 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  53.22 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  47.21 
 
 		 359 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  44.57 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  31.27 
 
 		 361 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  26.87 
 
 		 360 aa  139  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  27.91 
 
 		 358 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  23.81 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 360 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  26.68 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  25.47 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.86 
 
 		 358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.65 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  22.16 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25.33 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  22.22 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  23.75 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 792 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 395 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 395 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  27.53 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  24.25 
 
 		 394 aa  93.2  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  24.34 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  22.88 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25.96 
 
 		 418 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.84 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.87 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  25.14 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.73 
 
 		 401 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 357 aa  89.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  25 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.06 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 		 1111 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  26.22 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  23.36 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  23.16 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  22.43 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  23.83 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  24.52 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  23.34 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  23.34 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  22.19 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.73 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  24.2 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  22.66 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  23.97 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.37 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 1061 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  22.68 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 1061 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  25.61 
 
 		 1040 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  22.72 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  23.7 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  21.53 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  22.57 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  24.25 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  20.27 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  20.27 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.76 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  22.86 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  24.38 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 1096 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  22.34 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 		 441 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  21.79 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  21.79 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  21.64 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  24.46 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  22.82 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>