103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1242 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  81 
 
 		 400 aa  635    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  798    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  88.5 
 
 		 400 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  73.57 
 
 		 401 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  73.57 
 
 		 401 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  73.57 
 
 		 401 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  71.75 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  73.07 
 
 		 401 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  72.57 
 
 		 401 aa  581  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  73.07 
 
 		 401 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  72.57 
 
 		 401 aa  580  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  73.07 
 
 		 401 aa  579  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  77 
 
 		 399 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  72.07 
 
 		 401 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  71.93 
 
 		 399 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  69 
 
 		 397 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  71.68 
 
 		 399 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  75 
 
 		 400 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  71.15 
 
 		 406 aa  541  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  71.82 
 
 		 401 aa  542  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  68.25 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  68.5 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  40.5 
 
 		 381 aa  308  9e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  41.94 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  41.19 
 
 		 400 aa  279  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  40.7 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  41.54 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  42.08 
 
 		 400 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  38.33 
 
 		 400 aa  253  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  40.65 
 
 		 380 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  36.07 
 
 		 397 aa  240  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  35.93 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  25.75 
 
 		 349 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  24.63 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  21.72 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  25.96 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  22.79 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  22.79 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  22.79 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  22.55 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.88 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  22.55 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  26.78 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  22.6 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  22.55 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  29.41 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  28.19 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  23.1 
 
 		 354 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  24.88 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  20.66 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  20 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  28.1 
 
 		 350 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  27.22 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  22.78 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  22.78 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  24.71 
 
 		 385 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  30.25 
 
 		 354 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  30.25 
 
 		 354 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  24.31 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.63 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.75 
 
 		 420 aa  49.7  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  21.14 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  27.55 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  25.56 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  21.69 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  31.3 
 
 		 390 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  29.51 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  22.69 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  22.14 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  26.19 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.32 
 
 		 809 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.32 
 
 		 646 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  28.67 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  29.92 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  29.92 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  28.79 
 
 		 793 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  25.4 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.53 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  25 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  24.23 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  22.3 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  26.97 
 
 		 841 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.19 
 
 		 416 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  20.83 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  28.91 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  21.43 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  25 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  21.61 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  25.82 
 
 		 791 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  21.46 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.66 
 
 		 424 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 372 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.05 
 
 		 847 aa  43.1  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  26.11 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  25.15 
 
 		 385 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 		 378 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>