More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0475 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  86.75 
 
 		 250 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  85.54 
 
 		 250 aa  443  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  84.34 
 
 		 250 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  84.27 
 
 		 250 aa  433  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  75.5 
 
 		 250 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  77.91 
 
 		 250 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  54.84 
 
 		 247 aa  289  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  53.31 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  53.23 
 
 		 247 aa  284  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  53.23 
 
 		 247 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  54.03 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  52.42 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  51.59 
 
 		 248 aa  274  9e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  53.72 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  52.59 
 
 		 253 aa  271  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  50.81 
 
 		 247 aa  271  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  50.2 
 
 		 249 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  52.26 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  48.21 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  52.4 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  48.39 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  52.02 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  52.02 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  49.2 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  51.45 
 
 		 246 aa  254  9e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  50.79 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  50.2 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  49.2 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  50.4 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  51.64 
 
 		 243 aa  251  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  47.98 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  48.59 
 
 		 253 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  47.58 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  49.79 
 
 		 242 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  52.57 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  248  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  53.41 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  51.65 
 
 		 245 aa  248  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  46.4 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  48.19 
 
 		 253 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  50.63 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  48.8 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  47.13 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  48.39 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  51.24 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  46.83 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  51.25 
 
 		 240 aa  246  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  48.19 
 
 		 252 aa  244  8e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  48.19 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  48.99 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  48.37 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  47.74 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  49.18 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  50.4 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  49 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  48.19 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  48.59 
 
 		 250 aa  241  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  52.8 
 
 		 251 aa  241  7e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  49 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  48.4 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  47.01 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  48.8 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  47.2 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  48 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  49.38 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  46.99 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  47.6 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  48.54 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  48.54 
 
 		 243 aa  238  6.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  48.19 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  49.6 
 
 		 247 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  48.98 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  43.37 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  49.6 
 
 		 255 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  48.98 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  47.79 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  46.77 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  47.18 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  49.59 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  44.58 
 
 		 249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  47.01 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  47.64 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  49.37 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  49.17 
 
 		 239 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  46.4 
 
 		 250 aa  234  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  47.79 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>