More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06100 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  51.47 
 
 		 724 aa  663    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 716 aa  1467    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14210  penicillin-binding protein 2  48.12 
 
 		 709 aa  603  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  46.38 
 
 		 669 aa  518  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  31.05 
 
 		 574 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.34 
 
 		 643 aa  316  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  32.58 
 
 		 646 aa  312  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.15 
 
 		 639 aa  306  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.36 
 
 		 645 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 		 687 aa  303  8.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  32.22 
 
 		 667 aa  300  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.56 
 
 		 636 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.94 
 
 		 586 aa  296  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 		 645 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.44 
 
 		 647 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 		 670 aa  294  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  32.03 
 
 		 800 aa  294  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 		 642 aa  293  9e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  31.47 
 
 		 697 aa  293  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  31.91 
 
 		 678 aa  291  4e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 		 609 aa  290  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 		 634 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  30.88 
 
 		 716 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.97 
 
 		 771 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  32.29 
 
 		 802 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  30.85 
 
 		 644 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  31.71 
 
 		 803 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  31.71 
 
 		 809 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  31.71 
 
 		 803 aa  283  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  31.48 
 
 		 619 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.18 
 
 		 681 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 		 767 aa  281  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  30.15 
 
 		 640 aa  280  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  32.18 
 
 		 648 aa  280  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  31.55 
 
 		 802 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  31.55 
 
 		 802 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 636 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  31.55 
 
 		 802 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  31.55 
 
 		 802 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  29.36 
 
 		 597 aa  277  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 		 766 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.64 
 
 		 646 aa  274  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 646 aa  273  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  31.13 
 
 		 801 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  27.71 
 
 		 661 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  29.88 
 
 		 775 aa  272  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  31.46 
 
 		 673 aa  272  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  31.13 
 
 		 801 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 		 664 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 703 aa  271  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 		 662 aa  270  7e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 		 793 aa  270  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  31.77 
 
 		 760 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 		 765 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 		 765 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  30.4 
 
 		 679 aa  269  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  31.4 
 
 		 775 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 		 761 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  31.32 
 
 		 729 aa  269  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  31.61 
 
 		 756 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  29.58 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 		 764 aa  269  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  31.13 
 
 		 801 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 		 655 aa  266  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 		 624 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  29.16 
 
 		 599 aa  265  3e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  31.68 
 
 		 764 aa  263  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 		 671 aa  263  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  28.96 
 
 		 658 aa  263  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.73 
 
 		 629 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  31 
 
 		 655 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 		 691 aa  260  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  31.03 
 
 		 635 aa  260  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  28.8 
 
 		 632 aa  260  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 		 686 aa  260  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 631 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  29.72 
 
 		 647 aa  256  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.28 
 
 		 631 aa  256  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 630 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 		 618 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  30 
 
 		 617 aa  255  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  28.13 
 
 		 586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  30.05 
 
 		 617 aa  255  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  29.42 
 
 		 588 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  29.57 
 
 		 631 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  28.8 
 
 		 640 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 		 623 aa  253  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  28.17 
 
 		 647 aa  253  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  29.79 
 
 		 602 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 		 623 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  29.79 
 
 		 602 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  30.91 
 
 		 646 aa  252  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 		 623 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.11 
 
 		 629 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  29.46 
 
 		 621 aa  251  3e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  29.82 
 
 		 623 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  28.11 
 
 		 618 aa  251  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  30.67 
 
 		 630 aa  251  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  29.61 
 
 		 689 aa  250  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  29.66 
 
 		 623 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>