More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2600 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 486 aa  1007    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  46.37 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  35.1 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  34.98 
 
 		 464 aa  320  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  29.62 
 
 		 518 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  33.75 
 
 		 474 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 450 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 481 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  26.01 
 
 		 450 aa  136  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  28.13 
 
 		 447 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 452 aa  126  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  25.8 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  36.48 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  24.05 
 
 		 489 aa  117  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 447 aa  113  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  28.61 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  25.73 
 
 		 477 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 728 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  23.73 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  24.6 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 489 aa  104  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  23.43 
 
 		 492 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 452 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.5 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 351 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 477 aa  94.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 		 460 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  35.92 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  35.92 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  35.92 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  33.79 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  32.21 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  32.21 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  32.1 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  25.08 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  27.62 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 365 aa  73.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  29.76 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  34.27 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  34.27 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  26.83 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  34.27 
 
 		 385 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  34.27 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0737  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.23 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  31.76 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>