246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1800 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
348 aa  697    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.07 
 
 
351 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.19 
 
 
343 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.03 
 
 
347 aa  288  8e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  42.05 
 
 
344 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.9 
 
 
344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  42.2 
 
 
344 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  41.89 
 
 
339 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  41.89 
 
 
339 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.2 
 
 
343 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.7 
 
 
344 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.07 
 
 
345 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.13 
 
 
345 aa  266  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  41.03 
 
 
338 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  41.03 
 
 
338 aa  255  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  40.29 
 
 
338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  40.29 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.51 
 
 
345 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  40.73 
 
 
338 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  40.73 
 
 
338 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  40.73 
 
 
338 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  40.43 
 
 
338 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  40.73 
 
 
338 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.32 
 
 
347 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  40.12 
 
 
338 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.53 
 
 
341 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  40.43 
 
 
343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.52 
 
 
343 aa  245  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.39 
 
 
343 aa  239  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.34 
 
 
343 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.56 
 
 
357 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.92 
 
 
343 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.01 
 
 
342 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.19 
 
 
344 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.83 
 
 
343 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.62 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.69 
 
 
343 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.12 
 
 
343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.07 
 
 
348 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.73 
 
 
343 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.73 
 
 
354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.68 
 
 
357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.36 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.1 
 
 
355 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  32.92 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.13 
 
 
351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.64 
 
 
355 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  32.92 
 
 
349 aa  195  7e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  31.67 
 
 
352 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.73 
 
 
352 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  32.83 
 
 
349 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  32 
 
 
353 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  32 
 
 
353 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  32.59 
 
 
360 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 
342 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 
340 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.58 
 
 
357 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.13 
 
 
351 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  31.33 
 
 
343 aa  189  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  31.69 
 
 
348 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 
370 aa  189  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 
351 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.86 
 
 
350 aa  188  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 
350 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.18 
 
 
337 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.37 
 
 
345 aa  187  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  33.03 
 
 
336 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  30.39 
 
 
364 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  29.12 
 
 
340 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
337 aa  186  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.95 
 
 
355 aa  185  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  30.55 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  30.86 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  29.06 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.55 
 
 
337 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  32.86 
 
 
357 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  31.21 
 
 
342 aa  182  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.17 
 
 
340 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.55 
 
 
363 aa  182  7e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  31.25 
 
 
353 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  29.39 
 
 
343 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.29 
 
 
373 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  31.1 
 
 
340 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  31.1 
 
 
340 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  32.59 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.35 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  31.1 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  32.59 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  31.1 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  31.1 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.64 
 
 
357 aa  180  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  32.32 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  31.4 
 
 
367 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.33 
 
 
350 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.99 
 
 
355 aa  179  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  30.79 
 
 
340 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  31.8 
 
 
342 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  33.23 
 
 
358 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.64 
 
 
359 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  28.91 
 
 
343 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>