More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4819 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  100 
 
 
200 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  56.41 
 
 
221 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  55.63 
 
 
208 aa  171  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  42.95 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  43.14 
 
 
235 aa  142  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  42.48 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  40.38 
 
 
219 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  40.23 
 
 
220 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  39.9 
 
 
196 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  39.22 
 
 
234 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  41.33 
 
 
213 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  43.12 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  43.12 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  42.5 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  40.27 
 
 
247 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  45.03 
 
 
177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  38.67 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  38.27 
 
 
216 aa  127  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  35.64 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  34.85 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  41.57 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  39.39 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  38.42 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  37.89 
 
 
191 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  38.61 
 
 
187 aa  121  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  36.95 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  36.95 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  38.41 
 
 
178 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  38.75 
 
 
190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  38 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  38.67 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  37.33 
 
 
153 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  34.18 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  35.23 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  40.67 
 
 
152 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  39.47 
 
 
196 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  38.16 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  30.61 
 
 
192 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  33.15 
 
 
185 aa  101  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  44.64 
 
 
455 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  40 
 
 
455 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  39.47 
 
 
419 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  33.76 
 
 
185 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  35.76 
 
 
185 aa  99  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  42.19 
 
 
437 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  33.95 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  35.37 
 
 
177 aa  95.5  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  45.19 
 
 
439 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  35.76 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  29.74 
 
 
473 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.21 
 
 
193 aa  91.7  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  29.38 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  33.91 
 
 
232 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  40.83 
 
 
816 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  43.22 
 
 
452 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  33.02 
 
 
492 aa  85.5  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  35.37 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  32.12 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  36.84 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  33.99 
 
 
264 aa  82  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  30.06 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  36.67 
 
 
478 aa  81.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  30.54 
 
 
495 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  31.67 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  34.27 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  39.34 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  32.87 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  30.34 
 
 
495 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  30.34 
 
 
495 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  33.59 
 
 
410 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  26.64 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  37.6 
 
 
425 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  26.64 
 
 
270 aa  74.7  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  32.31 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  31.71 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  34.48 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  39.58 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  28.63 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  27.94 
 
 
436 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  30.73 
 
 
373 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  32.45 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  28.99 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  28.74 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  27.54 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  28.39 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  30.29 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  30.29 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  27.75 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  36.46 
 
 
434 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  30.29 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  32.41 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  27.01 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  27.57 
 
 
344 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.74 
 
 
378 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  35.71 
 
 
264 aa  68.2  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  28.07 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  37.17 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  29.41 
 
 
920 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  24.7 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  30.49 
 
 
551 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>