94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2851 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2851  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
189 aa  374  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.796237  normal  0.0465369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3237  phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 
193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.879445  normal  0.545559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57574  putative transcription initiation factor  39.13 
 
 
439 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.625866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  43.02 
 
 
224 aa  51.6  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 
238 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 
238 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 
232 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  39.77 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 
238 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 
249 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  42.53 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 
234 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  44.93 
 
 
336 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 
243 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  41.86 
 
 
200 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  45.78 
 
 
242 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  45.12 
 
 
233 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 
223 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0088  phosphoglycerate mutase family protein  33.66 
 
 
246 aa  45.1  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0362  phosphoglycerate mutase  39.56 
 
 
210 aa  45.1  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 
233 aa  44.7  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
210 aa  44.7  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1123  phosphoglycerate mutase  43.59 
 
 
91 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0349  Phosphoglycerate mutase  38 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  42.17 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
401 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  43.66 
 
 
374 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
322 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  39.73 
 
 
230 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  23.53 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2906  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  34.83 
 
 
292 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 
205 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 
214 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  28.22 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 
233 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.14 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1619  phosphoglycerate mutase family protein  28.92 
 
 
191 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.43 
 
 
163 aa  42.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1745  phosphoglycerate mutase family protein  28.92 
 
 
191 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  36.14 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 
190 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1876  phosphoglycerate mutase family protein  28.92 
 
 
189 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 
205 aa  42  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  28.38 
 
 
163 aa  42  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 
258 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  33.33 
 
 
200 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
204 aa  42  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 
215 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.18 
 
 
200 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 
201 aa  41.6  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.18 
 
 
200 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 
226 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 
226 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 
204 aa  41.6  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 
226 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 
201 aa  41.6  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  32.58 
 
 
197 aa  41.6  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12100  fructose-2,6-bisphosphatase  39.53 
 
 
279 aa  41.6  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0451501  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 
215 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 
215 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 
215 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  39.53 
 
 
200 aa  41.6  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 
215 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 
215 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  44.74 
 
 
234 aa  41.6  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 
207 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  33.72 
 
 
243 aa  41.2  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1571  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  28.92 
 
 
191 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1580  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  28.92 
 
 
191 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315491  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  26.18 
 
 
220 aa  41.2  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  41.79 
 
 
259 aa  40.8  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 
200 aa  41.2  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>