249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1123 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1123  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 91 aa  181  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510018 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  46.59 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  47.13 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  42.5 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  47.5 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  40.7 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  43.18 
 
 		 259 aa  53.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 224 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  41.03 
 
 		 225 aa  52.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  46.07 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  42.53 
 
 		 224 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  34.12 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 		 220 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 220 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2062  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 229 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.792733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 227 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  34.07 
 
 		 207 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 225 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  40.51 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 220 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 		 214 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 		 214 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  43.66 
 
 		 221 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  45.95 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0041  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 197 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 		 206 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 205 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 		 224 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  36.62 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2851  phosphoglycerate mutase  43.59 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.796237  normal  0.0465369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  39.77 
 
 		 252 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.45 
 
 		 266 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  39.74 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  24.42 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  24.42 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  36.17 
 
 		 220 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1696  Phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 		 402 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 212 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  36.78 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  36.9 
 
 		 232 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  36.78 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  36.78 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  32.58 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.63 
 
 		 382 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  36.99 
 
 		 189 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  40.23 
 
 		 391 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.07 
 
 		 200 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.07 
 
 		 200 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  35.11 
 
 		 229 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  35.11 
 
 		 229 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 440 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  37.66 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 220 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 220 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  35.11 
 
 		 220 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 220 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  34.04 
 
 		 229 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  46.03 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 221 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  36.51 
 
 		 195 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 216 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 214 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.65 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.41 
 
 		 205 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  39.33 
 
 		 442 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  42.05 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>