More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2062 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2062  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 229 aa  478  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.792733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  46.08 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1395  phosphoglycerate mutase 1  43.56 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0143791  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  43.61 
 
 		 249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  44.91 
 
 		 229 aa  194  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  43.98 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0773  phosphoglycerate mutase 1 family  44.29 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.9005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  41.74 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  43.52 
 
 		 248 aa  191  9e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  43.06 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  42.29 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  41.4 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  41.85 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  41.78 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  42.38 
 
 		 601 aa  189  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  41.78 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  43.06 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  40.27 
 
 		 247 aa  187  9e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  41.41 
 
 		 249 aa  187  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  38.94 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  41.2 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  41.28 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  44.39 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  41.55 
 
 		 245 aa  184  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  41.13 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  43.13 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  41.1 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  41.1 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  39.81 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  41.1 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  41.1 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  39.82 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  40 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  39.81 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  40.09 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  43.93 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  40.71 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  43.46 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  42.86 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  40.17 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  40.64 
 
 		 245 aa  181  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  41.9 
 
 		 240 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  41.1 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  41.1 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  41.47 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  41.94 
 
 		 245 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  38.5 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  42.52 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  41.9 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  41.71 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  40.93 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  40.64 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  42.52 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  40.87 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  41.67 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  39.91 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 250 aa  178  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  40.64 
 
 		 245 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  40.64 
 
 		 293 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  40.55 
 
 		 250 aa  178  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  40 
 
 		 228 aa  177  9e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  38.71 
 
 		 236 aa  177  9e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  38.25 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  40.93 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  38.6 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  40.91 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  41.15 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  41.86 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  42.73 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  42.06 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  41.43 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  37.61 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  40.47 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  41.94 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  40.53 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  40.83 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  41.28 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  41.9 
 
 		 247 aa  174  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  41.63 
 
 		 257 aa  174  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 		 249 aa  174  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  42.08 
 
 		 251 aa  174  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  41.9 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  40.65 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  41.59 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>