More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0185 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  100 
 
 		 404 aa  829    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  69.65 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1122  radical SAM protein  62.03 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  64.3 
 
 		 399 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  63.52 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  62.99 
 
 		 403 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  63.52 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  62.73 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2966  radical SAM enzyme, Cfr family  62.11 
 
 		 399 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.80573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  61.36 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4556  radical SAM protein  58.31 
 
 		 431 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15006  decreased coverage  0.00152892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  61.36 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4488  radical SAM enzyme, Cfr family  57.93 
 
 		 431 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0398  radical SAM protein  61.38 
 
 		 414 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0578367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  61.36 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0076  hypothetical protein  56.1 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  61.23 
 
 		 399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0090  radical SAM protein  56.1 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0077  hypothetical protein  56.1 
 
 		 411 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3068  radical SAM protein  59.21 
 
 		 413 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2859  radical SAM protein  59.06 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3724  radical SAM enzyme, Cfr family  59.47 
 
 		 408 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4047  radical SAM enzyme, Cfr family  59.74 
 
 		 409 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  59.74 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4168  Fe-S-cluster redox protein  57.73 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  62.02 
 
 		 410 aa  458  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  60.37 
 
 		 397 aa  454  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  60.28 
 
 		 391 aa  454  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0759  radical SAM protein  58.49 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  59.47 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  59.47 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  58.67 
 
 		 392 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1362  radical SAM protein  56.04 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  59.35 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  59.84 
 
 		 406 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  58.15 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2962  radical SAM protein  55.91 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.161045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1436  hypothetical protein  53.42 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3014  hypothetical protein  55.64 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  59.09 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0703  hypothetical protein  52.88 
 
 		 420 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  55.32 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  51.72 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  49.05 
 
 		 377 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  50.56 
 
 		 356 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  49.71 
 
 		 382 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  49.28 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  48.21 
 
 		 362 aa  339  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  48.02 
 
 		 376 aa  339  5e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  51.07 
 
 		 360 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  49.43 
 
 		 379 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.38 
 
 		 398 aa  335  7.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 		 373 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 		 373 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.57 
 
 		 373 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  49.14 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.72 
 
 		 373 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  48.1 
 
 		 382 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  48.99 
 
 		 381 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.29 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  45.79 
 
 		 381 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  47.72 
 
 		 382 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  47.7 
 
 		 381 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  47.7 
 
 		 381 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  47.58 
 
 		 381 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.28 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1429  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.29 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0876618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.14 
 
 		 373 aa  332  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  51.21 
 
 		 373 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50 
 
 		 373 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  47.83 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.57 
 
 		 373 aa  331  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  49.71 
 
 		 383 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  45.8 
 
 		 382 aa  328  7e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  45.53 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  48.84 
 
 		 383 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.71 
 
 		 373 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  48.84 
 
 		 383 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.42 
 
 		 373 aa  325  7e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.42 
 
 		 373 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  45.89 
 
 		 372 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1930  radical SAM enzyme, Cfr family  49.17 
 
 		 362 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1602  radical SAM enzyme, Cfr family  49.17 
 
 		 363 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.113295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.14 
 
 		 373 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  44.89 
 
 		 403 aa  323  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  47.43 
 
 		 370 aa  322  5e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.14 
 
 		 373 aa  323  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  47.43 
 
 		 370 aa  322  5e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  46.15 
 
 		 413 aa  322  6e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  46.15 
 
 		 409 aa  322  7e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  49.4 
 
 		 384 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  48.25 
 
 		 382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1657  radical SAM enzyme, Cfr family  47 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33058  normal  0.466299 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01053  radical SAM enzyme, Cfr family  47.91 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06113  radical SAM enzyme, Cfr family  47.91 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245547  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  48.95 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.72 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  48.5 
 
 		 364 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  44.68 
 
 		 370 aa  317  3e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  46.84 
 
 		 375 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>