More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4556 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4556  radical SAM protein  100 
 
 		 431 aa  880    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15006  decreased coverage  0.00152892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  78.55 
 
 		 425 aa  682    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1122  radical SAM protein  78.84 
 
 		 430 aa  686    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  78.87 
 
 		 425 aa  681    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  78.87 
 
 		 425 aa  681    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4488  radical SAM enzyme, Cfr family  95.82 
 
 		 431 aa  853    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0759  radical SAM protein  75.58 
 
 		 391 aa  608  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2966  radical SAM enzyme, Cfr family  71.39 
 
 		 399 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.80573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  67.09 
 
 		 399 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  68.61 
 
 		 403 aa  554  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  68.11 
 
 		 399 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0398  radical SAM protein  70.37 
 
 		 414 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0578367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  68.15 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  67.09 
 
 		 398 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2859  radical SAM protein  63.7 
 
 		 408 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  67.18 
 
 		 397 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4168  Fe-S-cluster redox protein  60.43 
 
 		 410 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  64.57 
 
 		 399 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3068  radical SAM protein  63.13 
 
 		 413 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3724  radical SAM enzyme, Cfr family  64.58 
 
 		 408 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4047  radical SAM enzyme, Cfr family  63.4 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0076  hypothetical protein  63.78 
 
 		 411 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0090  radical SAM protein  63.52 
 
 		 411 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0077  hypothetical protein  63.52 
 
 		 411 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1362  radical SAM protein  60.99 
 
 		 414 aa  494  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  63.64 
 
 		 399 aa  487  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  58.31 
 
 		 404 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  56.93 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  58.35 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  59.21 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  59.2 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  56.12 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  56.12 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  57.51 
 
 		 406 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  56.12 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2962  radical SAM protein  56.84 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.161045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  56.36 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  57.94 
 
 		 390 aa  431  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1436  hypothetical protein  54.95 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3014  hypothetical protein  54.89 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0703  hypothetical protein  53.59 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  53.14 
 
 		 339 aa  378  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  47.03 
 
 		 382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  49.73 
 
 		 376 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  46.76 
 
 		 382 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  47.58 
 
 		 356 aa  335  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  46.2 
 
 		 381 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  46.2 
 
 		 381 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  45.92 
 
 		 381 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  46.2 
 
 		 381 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  44.76 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1602  radical SAM enzyme, Cfr family  49.73 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.113295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1930  radical SAM enzyme, Cfr family  49.73 
 
 		 362 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  49.18 
 
 		 366 aa  332  8e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  46.75 
 
 		 360 aa  332  8e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  46.47 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  46.47 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  45.9 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  46.11 
 
 		 362 aa  326  6e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  46.91 
 
 		 371 aa  326  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  45.41 
 
 		 369 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  44.03 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  47.43 
 
 		 375 aa  323  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  48.28 
 
 		 382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  46.35 
 
 		 364 aa  319  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1422  radical SAM protein  48.33 
 
 		 382 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12366  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  45.21 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2543  radical SAM enzyme, Cfr family  47.79 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  hitchhiker  0.00648935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  45.21 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1461  radical SAM protein  47.53 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0453987  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  49.27 
 
 		 365 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1657  radical SAM enzyme, Cfr family  42.82 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33058  normal  0.466299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1592  hypothetical protein  47.51 
 
 		 383 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  48.16 
 
 		 383 aa  316  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  46.56 
 
 		 377 aa  316  5e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  48.84 
 
 		 379 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  47.59 
 
 		 383 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  47.31 
 
 		 383 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1725  radical SAM protein  46.99 
 
 		 379 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1752  radical SAM protein  46.99 
 
 		 379 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  48.55 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2232  radical SAM protein  47.97 
 
 		 378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  48.55 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  48.55 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  47.67 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2230  radical SAM protein  47.67 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  47.67 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1347  radical SAM protein  47.67 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  47.67 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1837  radical SAM protein  47.67 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  47.67 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  46.47 
 
 		 402 aa  313  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1716  radical SAM protein  45.97 
 
 		 401 aa  312  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973881  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1780  hypothetical protein  45.97 
 
 		 406 aa  312  9e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.9 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  48.26 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01053  radical SAM enzyme, Cfr family  47.16 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184624  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1290  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.97 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1183  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.97 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>