More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3023 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  70.81 
 
 		 221 aa  300  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  69.19 
 
 		 223 aa  296  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  66.04 
 
 		 209 aa  295  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  51.67 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  49.52 
 
 		 207 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  49.52 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  48.56 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  49.03 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  46.86 
 
 		 209 aa  194  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  43.84 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  42.52 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  48.08 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  43.19 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 		 206 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  47.83 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  42.25 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  47.32 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  47.32 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  42.73 
 
 		 235 aa  177  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  42.73 
 
 		 235 aa  177  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  41.1 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  45.93 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  41.55 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  45.77 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  45.77 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  46.15 
 
 		 207 aa  175  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  46 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  45.1 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  43.41 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  42.51 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  44.98 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  43.9 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  46.34 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 207 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  41.63 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  40.98 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  43.56 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  40.78 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  41.43 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0843  ribosomal protein L4/L1e  43.33 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  43.43 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  39.34 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  41.26 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  44.23 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  38.94 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  45.36 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  39.51 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  43.54 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  42.44 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03990  LSU ribosomal protein L4P  49.02 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  44.72 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  41.75 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  38.46 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  38.21 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  42.52 
 
 		 247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  38.57 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  42.05 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  37.2 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  40.49 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  41.55 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2974  50S ribosomal protein L4P  42.5 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  40 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  43.56 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  44.39 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2686  ribosomal protein L4/L1e  44.44 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  42 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  41.55 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  36.89 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  42.42 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  40.2 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  40.38 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  40.38 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  42.27 
 
 		 245 aa  144  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  38.35 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>