118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4618 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4618  sodium-type flagellar protein MotX  100 
 
 		 211 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00088  sodium-type polar flagellar protein MotX  51.52 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0993  Sel1 repeat-containing protein  54.14 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002265  sodium-type polar flagellar protein MotX  51.52 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03473  sodium-type flagellar motor component  50.48 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2179  sodium-type flagellar protein MotX  51.96 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000273255  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2771  sodium-type polar flagellar protein MotX  48.53 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3936  sodium-type flagellar protein MotX  42.72 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3265  Sel1 domain-containing protein  42.16 
 
 		 218 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000032376  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0682  Sel1 domain-containing protein  42.16 
 
 		 218 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0696  Sel1 domain-containing protein  42.16 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105771  hitchhiker  0.000122446 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0510  Sel1  43.68 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.209308  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3290  Sel1 domain-containing protein  43.48 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000129217  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3356  Sel1 domain-containing protein  45.25 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0708547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3591  Sel1 domain-containing protein  39.32 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000355002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0727  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.67 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159211  hitchhiker  0.00000977989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3648  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000102064  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0706  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00465752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0736  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00305878  hitchhiker  0.000755145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0751  Sel1 domain-containing protein  38.83 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000018908  hitchhiker  0.00284234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0748  Sel1 domain-containing protein  41.18 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000706188  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3068  sodium-type flagellar protein MotX  40.4 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.214299  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4218  Sel1 domain-containing protein  38.27 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.000336684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  28.06 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.78 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  35 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.78 
 
 		 271 aa  52  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30.23 
 
 		 680 aa  51.6  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  25 
 
 		 1072 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.64 
 
 		 684 aa  51.2  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.47 
 
 		 509 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  28.47 
 
 		 509 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  36.96 
 
 		 315 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  28.47 
 
 		 509 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  28.47 
 
 		 509 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  28.93 
 
 		 416 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.97 
 
 		 789 aa  48.9  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1037 aa  48.9  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  31.58 
 
 		 961 aa  48.5  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.75 
 
 		 838 aa  48.5  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 303 aa  48.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  32.32 
 
 		 236 aa  48.5  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 976 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  28.57 
 
 		 523 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.96 
 
 		 997 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  28.7 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.66 
 
 		 1263 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.61 
 
 		 831 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  34.34 
 
 		 1493 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1402 aa  47.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  32.89 
 
 		 765 aa  47.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  31.43 
 
 		 482 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  31.53 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.66 
 
 		 1260 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 1261 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0619  Sel1 domain-containing protein  33.73 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0618  Sel1 domain-containing protein  33.73 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000151187  normal  0.335089 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.21 
 
 		 859 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.95 
 
 		 2413 aa  46.2  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  31.21 
 
 		 552 aa  45.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  34.18 
 
 		 115 aa  46.2  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31 
 
 		 373 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3411  Sel1 domain-containing protein  33.73 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.001433  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  31.65 
 
 		 245 aa  45.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  38.16 
 
 		 685 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0496  tetratricopeptide repeat family protein  27.42 
 
 		 615 aa  45.1  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2699  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  36.07 
 
 		 202 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0148338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0625  hypothetical protein  32.53 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.96 
 
 		 490 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.96 
 
 		 490 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30 
 
 		 373 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  32.95 
 
 		 961 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.68 
 
 		 393 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.67 
 
 		 392 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 415 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 1430 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  32.93 
 
 		 1078 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.68 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  29.21 
 
 		 331 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  32.93 
 
 		 1044 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  36.59 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  29.87 
 
 		 763 aa  43.9  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.9 
 
 		 343 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  30.63 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  26.06 
 
 		 839 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.38 
 
 		 865 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  32.18 
 
 		 117 aa  43.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.73 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  31 
 
 		 337 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  30.63 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  30.38 
 
 		 693 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  34.67 
 
 		 464 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  43.1 
 
 		 839 aa  42.7  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.8 
 
 		 126 aa  42.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  31.62 
 
 		 293 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0477  tetratricopeptide repeat protein  32.91 
 
 		 496 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.486757  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.16 
 
 		 512 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0653  hypothetical protein  31.33 
 
 		 259 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0485  tetratricopeptide repeat protein  32.91 
 
 		 497 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791443 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>