More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2232 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  100 
 
 
214 aa  433  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  97.2 
 
 
214 aa  421  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  44.71 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  41.04 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  40.09 
 
 
216 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  40.09 
 
 
215 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  40.87 
 
 
212 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  40.09 
 
 
216 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  39.62 
 
 
216 aa  157  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  39.62 
 
 
216 aa  157  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  39.62 
 
 
216 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  39.62 
 
 
216 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  39.62 
 
 
216 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  41.83 
 
 
215 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  39.15 
 
 
216 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  41.35 
 
 
222 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  38.6 
 
 
221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.05 
 
 
219 aa  141  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  35.1 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.76 
 
 
218 aa  135  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.76 
 
 
212 aa  134  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.89 
 
 
217 aa  132  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  37.56 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  34.12 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.08 
 
 
296 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.08 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  31.6 
 
 
225 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.13 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  33.86 
 
 
225 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  28.78 
 
 
215 aa  101  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  28.78 
 
 
215 aa  101  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  29.95 
 
 
208 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  28.9 
 
 
226 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.39 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  32.58 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.15 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  33.87 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  33.87 
 
 
213 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  33.33 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.2 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  28.99 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.02 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  30.58 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  33.87 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  30.73 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
242 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
245 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
242 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
242 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 
216 aa  89  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
216 aa  88.6  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
245 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
242 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
242 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.07 
 
 
227 aa  88.6  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  27.48 
 
 
242 aa  88.6  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  27.32 
 
 
219 aa  88.2  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
231 aa  88.2  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  27.37 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  29.52 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  26.2 
 
 
228 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 
238 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  28.04 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 
227 aa  85.5  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
226 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  33.15 
 
 
217 aa  84.7  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  30.49 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.48 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  27.41 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  27.57 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.05 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  32.97 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  30.27 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  30.99 
 
 
233 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 
251 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.3 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  26.34 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  25.38 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  26.84 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  29.3 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  25.82 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  26.79 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  30.28 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.62 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  29.89 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>