More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0408 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  100 
 
 		 448 aa  905    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  97.32 
 
 		 448 aa  883    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.78 
 
 		 449 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  33.48 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  31.91 
 
 		 448 aa  246  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  32.58 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.52 
 
 		 466 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 		 492 aa  210  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.56 
 
 		 490 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.59 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  29.65 
 
 		 461 aa  190  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.05 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  28.64 
 
 		 495 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  27.65 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  29.07 
 
 		 458 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.07 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  26.26 
 
 		 487 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  27.03 
 
 		 461 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.62 
 
 		 474 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  27.07 
 
 		 479 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  26.56 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  27.27 
 
 		 501 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  27.11 
 
 		 465 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  26.43 
 
 		 470 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  27.37 
 
 		 456 aa  160  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.27 
 
 		 472 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.64 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  25.92 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  26.89 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.85 
 
 		 705 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  26.75 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  26.23 
 
 		 602 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  26.9 
 
 		 499 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  26.05 
 
 		 463 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  24.46 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  25.71 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  28.88 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  24.57 
 
 		 473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.11 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  25.28 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.78 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.7 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4048  FAD linked oxidase domain-containing protein  27 
 
 		 476 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  24.17 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  27.07 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  28.88 
 
 		 456 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.81 
 
 		 478 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  27.13 
 
 		 476 aa  136  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  27.23 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  23.49 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  25.22 
 
 		 459 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.71 
 
 		 444 aa  133  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  26.71 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.39 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  26.54 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.52 
 
 		 476 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.27 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  24.06 
 
 		 532 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  35.6 
 
 		 459 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  34.54 
 
 		 479 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.22 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  32.47 
 
 		 462 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  24.03 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  22.84 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  27.07 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.39 
 
 		 891 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.36 
 
 		 542 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.5 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02648  isoamyl alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01180)  26.96 
 
 		 566 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.908923 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  33.51 
 
 		 465 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  24.59 
 
 		 448 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  27.29 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  31.66 
 
 		 864 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  24.73 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  23.02 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.5 
 
 		 614 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.54 
 
 		 896 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.54 
 
 		 896 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 		 864 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 		 864 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.78 
 
 		 472 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.18 
 
 		 461 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  31.03 
 
 		 894 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.66 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.56 
 
 		 896 aa  111  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.76 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  24.63 
 
 		 563 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.57 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  24.47 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  32 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  22.2 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  22.77 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.92 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.87 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  29.73 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  38.34 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0480  hypothetical protein  42.2 
 
 		 112 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0485727  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  24.56 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.83 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.17 
 
 		 460 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>